METHODS FOR SELECTING AND PRODUCING SELECTIVE PHARMACEUTICAL COMPOUNDS AND COMPOSITIONS USING AN ESTABLISHED GENETICALLY ALTERED CELL-BASED LIBRARY RESPONSIVE TO TRANSCRIPTION FACTORS; GENETIC CONSTRUCTS AND LIBRARY THEREFOR

The methods and products that are described in the present patent application are designed to determine by serial analysis the transcriptional activation pathways used by any compound of interest that is biologically active in a cell. We have engineered a library of transgenic or recombinant cell lines that allow the identification of simultaneous transcriptional pathways possibly used by the compound. Each cell line constituting the library has been engineered by stable transfection thereof by retroviral integration, to carry a reporter gene under the transcriptional control of a particular transcription factor or family thereof endogenous to the host cell. This is achieved by having the expression of the reporter gene driven by a minimal promoter and a transcription factor responsive-element (TF-RE) or a tandem or concatemer thereof. In its complete form, the library contains a large collection of reporter constructs responding to individual factors, each of which can in turn be studied in a large repertory of cell lines. Such an approach provides a global view of gene transcription activation in response to diverse stimuli in multiple cellular environments and is a significant improvement over case-by-case approaches. A compound screened against such a library provides a profile of selectivity for a given transcription factor and for a given cell type, which profile is used to select good selective putative therapeutics. La présente invention concerne des procédés et des produits permettant de déterminer, par des analyses en série, les voies d'activation transcriptionnelle utilisées par n'importe lequel des composés d'intérêt biologiquement actifs dans une cellule. Une banque de lignées cellulaires de recombinaison ou transgéniques a été élaborée afin de permettre l'identification de voies transcriptionnelles simultanées éventuellement utilisées par le composé. Chaque lignée cellulaire composant la banque a été mise au point par transfection stable de celle-ci par intégration rétrovirale, de manière à transporter un gène rapporteur sous le contrôle transcriptionnel d'un facteur de transcription particulier ou d'une famille de celui-ci endogène à la cellule hôte. Ceci peut être réalisé par régulation par un promoteur minimal et par un élément sensible au facteur de transcription (TF-RE) ou un tandem ou un concatémère de ceux-ci de l'expression du gène rapporteur. Dans sa forme complète, la banque rassemble un grand nombre de constructions de rapporteurs