VISUALIZATION AND PROCESSING OF MULTIDIMENSIONAL DATA USING PREFILTERING AND SORTING CRITERIA

Complex multidimensional datasets generated by digital imaging spectroscopy can be organized and analyzed by applying software computer-based methods comprising sorting algorithms. Combinati these algorithms to images and graphical data, allow pixels or features to be rapidly and efficiently classif...

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Hauptverfasser: DILWORTH, MICHAEL, R, YANG, MARY, M, BYLINA, EDWARD, J, COLEMAN, WILLIAM, J, YOUVAN, DOUGLAS, C, ROBLES, STEVEN, J
Format: Patent
Sprache:eng ; fre
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Beschreibung
Zusammenfassung:Complex multidimensional datasets generated by digital imaging spectroscopy can be organized and analyzed by applying software computer-based methods comprising sorting algorithms. Combinati these algorithms to images and graphical data, allow pixels or features to be rapidly and efficiently classified into meaningful groups according to defined criteria. Multiple rounds of pixel or feature select be performed based on independent sorting criteria. In one embodement sorting by spectral criteria (e.g., intensity at a given wavelength) is combined with sorting by temporal criteria (e.g., absorbance at a given time) to identify microcolonies of recombinant organisms harboring mutated genes encoding enzymes having desirable kinetic attributes and substrate specificity. Restriction of the set of pixels analyzed in a subsequent sort based on criteria applied in an earlier sort ("sort and lock" analyses) minimize computational and storage resources. User-defined criteria can also be incorporated into the sorting process by means of a graphical user interface that comprises a visualization tools including a contour plot, a sorting bar and a grouping bar, an image window, and a plot window that allow run-time interactive identification of pixels or features meeting one or more criteria, and display of their associated spectral or kinetic data. these methods are useful for extracting information from imaging data in applications ranging from biology and medicine to remote sensing. Des ensembles de données multidimensionnelles complexes produits par spectroscopie à imagerie numérique peuvent être organisés et analysés grâce à l'application de procédés informatiques et de logiciels comprenant des algorithmes de tri. Ces algorithmes, combinés à des images et à des données graphiques, permettent de classer de manière rapide et efficace des pixels ou des caractéristiques en groupes cohérents, en fonction de critères définis. De multiples opérations de sélection de pixels ou de caractéristiques peuvent être effectuées sur la base de critères de tri indépendants. Dans une forme de réalisation, le tri par critères spectraux (p. ex. intensité à une longueur d'onde donnée) est combiné à un tri par critères temporels (p. ex. absorbance à un moment donné) pour identifier des microcolonies d'organismes recombinés hébergeant des gènes mutants qui codent pour des enzymes possédant des attributs cinétiques et une spécificité de substrat voulus. Une limitation de l'ensemble de pixel