A METHOD OF INCREASING THE SPECIFICITY OF OXY-LNA OLIGONUCLEOTIDES

The present invention relates to the field of chimeric oligonucleotides composed of oxy-LNA monomers and at least one non-oxy-LNA monomer located within the distance of no more than three bases form or at the mismatch position(s) which are useful for the discrimination between fully matched target n...

Ausführliche Beschreibung

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Hauptverfasser: KOSHKIN, ALEXEI, JAKOBSEN, MOGENS, HAVSTEEN
Format: Patent
Sprache:eng ; fre
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Beschreibung
Zusammenfassung:The present invention relates to the field of chimeric oligonucleotides composed of oxy-LNA monomers and at least one non-oxy-LNA monomer located within the distance of no more than three bases form or at the mismatch position(s) which are useful for the discrimination between fully matched target nucleic acids and target nucleic acids containing one or a few mismatches. This is achieved by modulating the ability of an oxy-LNA oligo to discriminate between its complementary nucleic acid target sequences and target sequences that comprise these mismatches, by incorporating at least one non-oxy-LNA monomer in the oxy-LNA oligo. In addition to the ability to modulate characteristics such as affinity, overall hydrophobicity and charge etc., non-oxy-LNAs can also be used to modulate the ability of "oxy-LNA" oligonucleotides to discriminate between matched and mismatched nucleic acid target sequences. La présente invention concerne le domaine des oligonucléotides chimériques composés de monomères oxy-LNA et d'au moins un monomère non-oxy-LNA situé à une distance n'étant pas supérieure à trois bases de la (des) position(s) de mésappariement ou au niveau de ladite (desdites) position(s), qui permettent d'assurer une discrimination entre les acides nucléiques cibles totalement appariés et les acides nucléiques cibles contenant un ou plusieurs mésappariements. Cela est assuré en modulant la capacité d'un oligo oxy-LNA à effectuer une discrimination entre ses séquences cibles d'acides nucléiques complémentaires et les séquences cibles qui comprennent ces mésappariements, en incorporant au moins un monomère non-oxy-LNA dans l'oligo oxy-LNA. Outre la capacité à moduler des caractéristiques telles que l'affinité, l'hydrophobicité globale et la charge, etc., les non-oxy-LNAs peuvent également moduler la capacité des oligonucléotides /= à assurer une discrimination entre les séquences cibles d'acides nucléiques appariées et non appariées.