TRANSCRIPTIONALLY SILENCED PLANT GENES

The invention relates to gene silencing as observed after integration of transgenes into plant genomes. Comparison of transcriptional gene expression between an Arabidopsis line carrying a silent transgene present in multiple copies and its mutant derivative mom1 impaired in silencing of the transgene revealed two cDNA clones which are expressed in the mutant plants, but not in the parental and not in wild type plants. Both clones are derived from the same family of transcripts referred to as TSI (Transcriptionally Silent Information). Genomic templates encoding TSI are repetitive elements with mainly pericentromeric location and conserved organization among various ecotypes. Transcriptional silencing of the genomic TSI templates is specifically released in the mutant Transcription of TSI can be used as a marker to identify a defective silencing pathway in a plant. L'invention concerne la réduction au silence de gènes, observée après intégration de transgènes dans des génomes végétaux. La comparaison de l'expression génique transcriptionnelle entre une ligne Arabidopsis transportant un transgène silencieux présent dans de multiples copies et son dérivé mutant mom1altéré dans la réduction au silence du transgène, a révélé deux clones d'ADNc exprimés dans les plantes mutantes, mais non dans les plantes parentales ni dans les plantes de type sauvage. Les deux clones sont dérivés de la même famille de transcrits connus sous le nom de TSI (information transcriptionnellement silencieuse). Les matrices génomiques codant pour TSI sont des éléments répétitifs dotés d'un emplacement principalement péricentromérique et une organisation conservée parmi divers écotypes. La réduction au silence transcriptionnelle des matrices génomiques TSI libérée de manière spécifique dans la transcription mutante de TSI peut être utilisée comme marqueur pour identifier une voie de réduction au silence défectueuse chez une plante.