ANALOGS OF UDP-MURNAC PEPTIDES, ASSAYS AND KITS

General compositions and methods for detecting Lipid I, Lipid II and peptidoglycan synthesis is disclosed. A method of screening for potential antibacterial agents is provided which requires bacterial membrane preparations or enriched enzyme preparations including at least one bacterial enzyme invol...

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Hauptverfasser: AXELROD, HELENA, R, BRANSTROM, ARTHUR, A
Format: Patent
Sprache:eng ; fre
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Beschreibung
Zusammenfassung:General compositions and methods for detecting Lipid I, Lipid II and peptidoglycan synthesis is disclosed. A method of screening for potential antibacterial agents is provided which requires bacterial membrane preparations or enriched enzyme preparations including at least one bacterial enzyme involved in the synthesis of Lipid I from UDP-MurNAc pentapeptide and undecaprenyl phosphate, at least one bacterial enzyme involved in the synthesis of Lipid II from Lipid I and UDP-GlcNAc and one or more bacterial enzymes involved in the further processing of Lipid II toward the downstream synthesis of peptidoglycan. The methods disclosed herein further provide a labeled UDP-MurNAc-peptide capable of serving as a substrate for a bacterial enzyme involved in the synthesis of Lipid I and a labeled UDP-GlcNAc capable of serving as a substrate for a bacterial enzyme involved in the synthesis of Lipid II. Conditions for further processing of Lipid II toward the downstream synthesis of peptidoglycan are also described. La présente invention concerne des procédés et des compositions générales de détection de lipide I et de lipide II et de synthèse de peptidoglycane. En outre, cette invention concerne un procédé de criblage d'agents potentiellement antibactériens nécessitant des préparations de membranes bactériennes, ou des préparations d'enzymes enrichies, comprenant au moins une enzyme bactérienne impliquée dans la synthèse de lipide I à partir de UDP-MurNAc pentapeptide et de phosphate undecaprényl, au moins une enzyme bactérienne impliquée dans la synthèse de lipide II à partir de lipide I et de UDP-GlcNAc, et d'une ou de plusieurs enzymes bactériennes impliquées dans le traitement ultérieur de lipide II pour la synthèse en aval de peptidoglycane. Ces procédés concernent une peptide UDP-MurNAc marquée capable de servir de substrat pour une enzyme bactérienne impliquée dans la synthèse de lipide I, et une UDP-GlcNAc marquée capable de servir de substrat pour une enzyme bactérienne impliquée dans la synthèse de lipide II. Par ailleurs, cette invention concerne les conditions de traitement ultérieur de lipide II pour la synthèse en aval de peptidoglycane.