METHOD OF GENETIC INDEL-TYPING OF STRAINS OF BRUCELLA MELITENSIS

FIELD: biotechnology.SUBSTANCE: method involves extraction of DNA from the analyzed strain, PCR with specific primers and electrophoretic detection of amplification products in an agarose gel. Characterized method is based on INDEL-markers, which represent insertions-deletions of several nucleotides...

Ausführliche Beschreibung

Gespeichert in:

Bibliographische Detailangaben
Hauptverfasser:	Kuznetsova Irina Vladimirovna, Bobrysheva Olga Viktorovna, Rusanova Diana Vladimirovna, Zhirov Andrej Mikhajlovich, Berdnikova Tatyana Vasilevna, Kovalev Dmitrij Anatolevich, Shapakov Nikolaj Andreevich, Pisarenko Sergej Vladimirovich, Zhilchenko Elena Borisovna, Ulshina Diana Vasilevna, Vodopyanov Aleksej Sergeevich, Siritsa Yuliya Vladimirovna, Ponomarenko Dmitrij Grigorevich, Khachaturova Anna Andreevna, Vodopyanov Sergej Olegovich, Evchenko Anna Yurevna, Kulichenko Aleksandr Nikolaevich
Format:	Patent
Sprache:	eng ; rus
Schlagworte:	BEER BIOCHEMISTRY CHEMISTRY COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL ORENZYMOLOGICAL PROCESSES ENZYMOLOGY MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEICACIDS OR MICROORGANISMS METALLURGY MICROBIOLOGY MUTATION OR GENETIC ENGINEERING PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS SPIRITS VINEGAR WINE
Online-Zugang:	Volltext bestellen
Tags:	Tag hinzufügen Keine Tags, Fügen Sie den ersten Tag hinzu!

Beschreibung
Zusammenfassung:	FIELD: biotechnology.SUBSTANCE: method involves extraction of DNA from the analyzed strain, PCR with specific primers and electrophoretic detection of amplification products in an agarose gel. Characterized method is based on INDEL-markers, which represent insertions-deletions of several nucleotides. Amplification is carried out with primers to each of ten INDEL-loci (RS05410, RS06765, RS11140, RS12095, RS12365, RS14755, RS16525, RS05465, RS14470 and RS16540), having two discriminated alleles. Results are recorded by electrophoretic detection; the size of the obtained fragment is determined using a molecular weight marker or allelic markers 1 and 2. Unique INDEL-genotype is established for each analyzed strain. This method can be used as an additional method of genotyping when establishing the spatial and temporal origin of the strain, determining the genesis of the outbreak, a source of infection, possible routes of bringing in brucellosis.EFFECT: what is declared is a method for molecular-genetic typing of Brucella melitensis strains.1 cl, 1 ex, 2 dwg Изобретение относится к области биотехнологии. Заявлен способ молекулярно-генетического типирования штаммов Brucella melitensis. Способ включает выделение ДНК из исследуемого штамма, постановку ПЦР со специфичными праймерами и электрофоретическую детекцию продуктов амплификации в агарозном геле. Охарактеризованный способ основан на INDEL-маркерах, представляющих собой вставки-делеции нескольких нуклеотидов. Амплификацию проводят с праймерами к каждому из десяти INDEL-локусов (RS05410, RS06765, RS11140, RS12095, RS12365, RS14755, RS16525, RS05465, RS14470 и RS16540), имеющих по две дискриминируемых аллели. Учет результатов проводят методом электрофоретической детекции, размер полученного фрагмента определяют с помощью маркера молекулярного веса или аллельных маркеров 1 и 2. Для каждого исследуемого штамма устанавливают уникальный INDEL-генотип. Данный метод может применяться в качестве дополнительного метода генотипирования при установлении пространственного и временного происхождения штамма, определении генеза вспышки заболевания, источника инфекции, возможных маршрутов заноса бруцеллеза. 1 пр., 2 ил.