MODIFIED DNA-APTAMERS LINKING EXTRACELLULAR DOMAIN EGFR

FIELD: biotechnology.SUBSTANCE: invention represents a method for producing new DNA-aptamers to EGFR (epidermal growth factor receptor) recognizing an extracellular protein domain and containing a chemically modified nucleotide. Invention describes aptamer deoxyribooligonucleotides specifically binding to EGFR and characterized by a nucleotide sequence of general formula ACGCACCATTTGTTTAATATGXTTTTTAATXCCCCTTGTGGTGTGT, where X is either thymidine or 5-(1-(4-pyrenbutanoic acid propylamide)-4-triazolyl)deoxyribouridine, wherein the modified nucleotide is present in the oligonucleotide in only one of the positions.EFFECT: developed aptamers have improved affinity for the human EGFR protein and its mutant form EGFR vIII.6 cl, 7 dwg, 3 ex Изобретение относится к области биотехнологии. Изобретение представляет собой способ получения новых ДНК-аптамеров к EGFR (epidermal growth factor receptor, рецептор эпидермального фактора роста), узнающих внеклеточный домен белка и содержащих химически модифицированный нуклеотид. В изобретении описаны аптамерные дезоксирибоолигонуклеотиды, специфически связывающиеся с EGFR и характеризующиеся нуклеотидной последовательностью общей формулы ACGCACCATTTGTTTAATATGXTTTTTAATXCCCCTTGTGGTGTGT, где X - либо тимидин, либо 5-(1-(пропиламид 4-пиренбутановой кислоты)-4-триазолил)дезоксирибоуридин, причем модифицированный нуклеотид присутствует в олигонуклеотиде только в одном из положений. Разработанные аптамеры обладают улучшенной аффинностью к белку EGFR человека и к его мутантной форме EGFR vIII. 6 н.п. ф-лы, 7 ил., 3 пр.