METHOD AND SYSTEM FOR DETERMINING NUCLEOTIDE SEQUENCE IN GIVEN REGION OF FOETAL GENOME

FIELD: biotechnologies.SUBSTANCE: group of inventions relates to biotechnology. Proposed are a method and a system for determining nucleotide sequence in a given region of a foetus genome. Method comprises the following steps: constructing a library for sequencing from genomic DNA sample from periph...

Ausführliche Beschreibung

Gespeichert in:
Bibliographische Detailangaben
Hauptverfasser: GE KHuejtszyuan, VAN TSzyun, YAN KHuanmin, CHZHAN Syutsin, LI KHuchao, I SHan, VAN TSzyan, CHEN SHenpej
Format: Patent
Sprache:eng ; rus
Schlagworte:
Online-Zugang:Volltext bestellen
Tags: Tag hinzufügen
Keine Tags, Fügen Sie den ersten Tag hinzu!
container_end_page
container_issue
container_start_page
container_title
container_volume
creator GE KHuejtszyuan
VAN TSzyun
YAN KHuanmin
CHZHAN Syutsin
LI KHuchao
I SHan
VAN TSzyan
CHEN SHenpej
description FIELD: biotechnologies.SUBSTANCE: group of inventions relates to biotechnology. Proposed are a method and a system for determining nucleotide sequence in a given region of a foetus genome. Method comprises the following steps: constructing a library for sequencing from genomic DNA sample from peripheral blood of a pregnant woman; sequencing the library for sequencing in order to obtain a sequencing result. Result of the foetus sequencing includes multiple data obtained during sequencing. Nucleotide sequence in a given region of the genome is determined by using hidden Markov model basing on the result of sequencing the foetus sequences in combination with genetic information upon a relative using Viterbi algorithm. System consists of a device of the library constructing, a sequenator and an analyzer.EFFECT: using the inventions enables performing a genetic typing of high accuracy.14 cl, 2 dwg, 1 tbl, 1 ex Группа изобретений относится к области биотехнологии. Предложены способ и система для определения нуклеотидной последовательности в заданной области генома плода. Способ включает следующие этапы: конструирование библиотеки для секвенирования из образца геномной ДНК из периферической крови беременной женщины; секвенирование библиотеки для секвенирования с целью получения результата секвенирования. Результат секвенирования плода включает множество полученных при секвенировании данных. Нуклеотидную последовательность в заданной области генома определяют посредством использования скрытой марковской модели на основании результата секвенирования последовательностей плода в сочетании с генетической информацией о родственнике с помощью алгоритма Витерби. Система состоит из аппарата конструирования библиотеки, секвенатора и анализатора. Использование изобретений позволяет произвести генотипирование с высокой точностью. 2 н. и 12 з.п. ф-лы, 2 ил., 1 табл., 1 пр.
format Patent
fullrecord <record><control><sourceid>epo_EVB</sourceid><recordid>TN_cdi_epo_espacenet_RU2597981C2</recordid><sourceformat>XML</sourceformat><sourcesystem>PC</sourcesystem><sourcerecordid>RU2597981C2</sourcerecordid><originalsourceid>FETCH-epo_espacenet_RU2597981C23</originalsourceid><addsrcrecordid>eNqNy70KwjAUhuEsDqLew7kBByuiHUvyJQ00J5ifQqdSJE6ihXr_6OAFOL3L865F75Bar6hhRXGICY60D6SQEJxly4Y4yw4-WQWKuGawBFkmY3swBRjrmbz-bkhNRwbsHbZidZ8eS9n9uhGkkWS7L_NrLMs83cqzvMeQq1N9ri8HWR3_IB8ktTBb</addsrcrecordid><sourcetype>Open Access Repository</sourcetype><iscdi>true</iscdi><recordtype>patent</recordtype></control><display><type>patent</type><title>METHOD AND SYSTEM FOR DETERMINING NUCLEOTIDE SEQUENCE IN GIVEN REGION OF FOETAL GENOME</title><source>esp@cenet</source><creator>GE KHuejtszyuan ; VAN TSzyun ; YAN KHuanmin ; CHZHAN Syutsin ; LI KHuchao ; I SHan ; VAN TSzyan ; CHEN SHenpej</creator><creatorcontrib>GE KHuejtszyuan ; VAN TSzyun ; YAN KHuanmin ; CHZHAN Syutsin ; LI KHuchao ; I SHan ; VAN TSzyan ; CHEN SHenpej</creatorcontrib><description>FIELD: biotechnologies.SUBSTANCE: group of inventions relates to biotechnology. Proposed are a method and a system for determining nucleotide sequence in a given region of a foetus genome. Method comprises the following steps: constructing a library for sequencing from genomic DNA sample from peripheral blood of a pregnant woman; sequencing the library for sequencing in order to obtain a sequencing result. Result of the foetus sequencing includes multiple data obtained during sequencing. Nucleotide sequence in a given region of the genome is determined by using hidden Markov model basing on the result of sequencing the foetus sequences in combination with genetic information upon a relative using Viterbi algorithm. System consists of a device of the library constructing, a sequenator and an analyzer.EFFECT: using the inventions enables performing a genetic typing of high accuracy.14 cl, 2 dwg, 1 tbl, 1 ex Группа изобретений относится к области биотехнологии. Предложены способ и система для определения нуклеотидной последовательности в заданной области генома плода. Способ включает следующие этапы: конструирование библиотеки для секвенирования из образца геномной ДНК из периферической крови беременной женщины; секвенирование библиотеки для секвенирования с целью получения результата секвенирования. Результат секвенирования плода включает множество полученных при секвенировании данных. Нуклеотидную последовательность в заданной области генома определяют посредством использования скрытой марковской модели на основании результата секвенирования последовательностей плода в сочетании с генетической информацией о родственнике с помощью алгоритма Витерби. Система состоит из аппарата конструирования библиотеки, секвенатора и анализатора. Использование изобретений позволяет произвести генотипирование с высокой точностью. 2 н. и 12 з.п. ф-лы, 2 ил., 1 табл., 1 пр.</description><language>eng ; rus</language><subject>BEER ; BIOCHEMISTRY ; CHEMISTRY ; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR ; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL ORENZYMOLOGICAL PROCESSES ; ENZYMOLOGY ; INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTEDFOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS ; MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEICACIDS OR MICROORGANISMS ; METALLURGY ; MICROBIOLOGY ; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING ; PHYSICS ; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS ; SPIRITS ; VINEGAR ; WINE</subject><creationdate>2016</creationdate><oa>free_for_read</oa><woscitedreferencessubscribed>false</woscitedreferencessubscribed></display><links><openurl>$$Topenurl_article</openurl><openurlfulltext>$$Topenurlfull_article</openurlfulltext><thumbnail>$$Tsyndetics_thumb_exl</thumbnail><linktohtml>$$Uhttps://worldwide.espacenet.com/publicationDetails/biblio?FT=D&amp;date=20160920&amp;DB=EPODOC&amp;CC=RU&amp;NR=2597981C2$$EHTML$$P50$$Gepo$$Hfree_for_read</linktohtml><link.rule.ids>230,308,780,885,25564,76547</link.rule.ids><linktorsrc>$$Uhttps://worldwide.espacenet.com/publicationDetails/biblio?FT=D&amp;date=20160920&amp;DB=EPODOC&amp;CC=RU&amp;NR=2597981C2$$EView_record_in_European_Patent_Office$$FView_record_in_$$GEuropean_Patent_Office$$Hfree_for_read</linktorsrc></links><search><creatorcontrib>GE KHuejtszyuan</creatorcontrib><creatorcontrib>VAN TSzyun</creatorcontrib><creatorcontrib>YAN KHuanmin</creatorcontrib><creatorcontrib>CHZHAN Syutsin</creatorcontrib><creatorcontrib>LI KHuchao</creatorcontrib><creatorcontrib>I SHan</creatorcontrib><creatorcontrib>VAN TSzyan</creatorcontrib><creatorcontrib>CHEN SHenpej</creatorcontrib><title>METHOD AND SYSTEM FOR DETERMINING NUCLEOTIDE SEQUENCE IN GIVEN REGION OF FOETAL GENOME</title><description>FIELD: biotechnologies.SUBSTANCE: group of inventions relates to biotechnology. Proposed are a method and a system for determining nucleotide sequence in a given region of a foetus genome. Method comprises the following steps: constructing a library for sequencing from genomic DNA sample from peripheral blood of a pregnant woman; sequencing the library for sequencing in order to obtain a sequencing result. Result of the foetus sequencing includes multiple data obtained during sequencing. Nucleotide sequence in a given region of the genome is determined by using hidden Markov model basing on the result of sequencing the foetus sequences in combination with genetic information upon a relative using Viterbi algorithm. System consists of a device of the library constructing, a sequenator and an analyzer.EFFECT: using the inventions enables performing a genetic typing of high accuracy.14 cl, 2 dwg, 1 tbl, 1 ex Группа изобретений относится к области биотехнологии. Предложены способ и система для определения нуклеотидной последовательности в заданной области генома плода. Способ включает следующие этапы: конструирование библиотеки для секвенирования из образца геномной ДНК из периферической крови беременной женщины; секвенирование библиотеки для секвенирования с целью получения результата секвенирования. Результат секвенирования плода включает множество полученных при секвенировании данных. Нуклеотидную последовательность в заданной области генома определяют посредством использования скрытой марковской модели на основании результата секвенирования последовательностей плода в сочетании с генетической информацией о родственнике с помощью алгоритма Витерби. Система состоит из аппарата конструирования библиотеки, секвенатора и анализатора. Использование изобретений позволяет произвести генотипирование с высокой точностью. 2 н. и 12 з.п. ф-лы, 2 ил., 1 табл., 1 пр.</description><subject>BEER</subject><subject>BIOCHEMISTRY</subject><subject>CHEMISTRY</subject><subject>COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR</subject><subject>CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL ORENZYMOLOGICAL PROCESSES</subject><subject>ENZYMOLOGY</subject><subject>INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTEDFOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS</subject><subject>MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEICACIDS OR MICROORGANISMS</subject><subject>METALLURGY</subject><subject>MICROBIOLOGY</subject><subject>MUTATION OR GENETIC ENGINEERING</subject><subject>PHYSICS</subject><subject>PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS</subject><subject>SPIRITS</subject><subject>VINEGAR</subject><subject>WINE</subject><fulltext>true</fulltext><rsrctype>patent</rsrctype><creationdate>2016</creationdate><recordtype>patent</recordtype><sourceid>EVB</sourceid><recordid>eNqNy70KwjAUhuEsDqLew7kBByuiHUvyJQ00J5ifQqdSJE6ihXr_6OAFOL3L865F75Bar6hhRXGICY60D6SQEJxly4Y4yw4-WQWKuGawBFkmY3swBRjrmbz-bkhNRwbsHbZidZ8eS9n9uhGkkWS7L_NrLMs83cqzvMeQq1N9ri8HWR3_IB8ktTBb</recordid><startdate>20160920</startdate><enddate>20160920</enddate><creator>GE KHuejtszyuan</creator><creator>VAN TSzyun</creator><creator>YAN KHuanmin</creator><creator>CHZHAN Syutsin</creator><creator>LI KHuchao</creator><creator>I SHan</creator><creator>VAN TSzyan</creator><creator>CHEN SHenpej</creator><scope>EVB</scope></search><sort><creationdate>20160920</creationdate><title>METHOD AND SYSTEM FOR DETERMINING NUCLEOTIDE SEQUENCE IN GIVEN REGION OF FOETAL GENOME</title><author>GE KHuejtszyuan ; VAN TSzyun ; YAN KHuanmin ; CHZHAN Syutsin ; LI KHuchao ; I SHan ; VAN TSzyan ; CHEN SHenpej</author></sort><facets><frbrtype>5</frbrtype><frbrgroupid>cdi_FETCH-epo_espacenet_RU2597981C23</frbrgroupid><rsrctype>patents</rsrctype><prefilter>patents</prefilter><language>eng ; rus</language><creationdate>2016</creationdate><topic>BEER</topic><topic>BIOCHEMISTRY</topic><topic>CHEMISTRY</topic><topic>COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR</topic><topic>CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL ORENZYMOLOGICAL PROCESSES</topic><topic>ENZYMOLOGY</topic><topic>INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTEDFOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS</topic><topic>MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEICACIDS OR MICROORGANISMS</topic><topic>METALLURGY</topic><topic>MICROBIOLOGY</topic><topic>MUTATION OR GENETIC ENGINEERING</topic><topic>PHYSICS</topic><topic>PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS</topic><topic>SPIRITS</topic><topic>VINEGAR</topic><topic>WINE</topic><toplevel>online_resources</toplevel><creatorcontrib>GE KHuejtszyuan</creatorcontrib><creatorcontrib>VAN TSzyun</creatorcontrib><creatorcontrib>YAN KHuanmin</creatorcontrib><creatorcontrib>CHZHAN Syutsin</creatorcontrib><creatorcontrib>LI KHuchao</creatorcontrib><creatorcontrib>I SHan</creatorcontrib><creatorcontrib>VAN TSzyan</creatorcontrib><creatorcontrib>CHEN SHenpej</creatorcontrib><collection>esp@cenet</collection></facets><delivery><delcategory>Remote Search Resource</delcategory><fulltext>fulltext_linktorsrc</fulltext></delivery><addata><au>GE KHuejtszyuan</au><au>VAN TSzyun</au><au>YAN KHuanmin</au><au>CHZHAN Syutsin</au><au>LI KHuchao</au><au>I SHan</au><au>VAN TSzyan</au><au>CHEN SHenpej</au><format>patent</format><genre>patent</genre><ristype>GEN</ristype><title>METHOD AND SYSTEM FOR DETERMINING NUCLEOTIDE SEQUENCE IN GIVEN REGION OF FOETAL GENOME</title><date>2016-09-20</date><risdate>2016</risdate><abstract>FIELD: biotechnologies.SUBSTANCE: group of inventions relates to biotechnology. Proposed are a method and a system for determining nucleotide sequence in a given region of a foetus genome. Method comprises the following steps: constructing a library for sequencing from genomic DNA sample from peripheral blood of a pregnant woman; sequencing the library for sequencing in order to obtain a sequencing result. Result of the foetus sequencing includes multiple data obtained during sequencing. Nucleotide sequence in a given region of the genome is determined by using hidden Markov model basing on the result of sequencing the foetus sequences in combination with genetic information upon a relative using Viterbi algorithm. System consists of a device of the library constructing, a sequenator and an analyzer.EFFECT: using the inventions enables performing a genetic typing of high accuracy.14 cl, 2 dwg, 1 tbl, 1 ex Группа изобретений относится к области биотехнологии. Предложены способ и система для определения нуклеотидной последовательности в заданной области генома плода. Способ включает следующие этапы: конструирование библиотеки для секвенирования из образца геномной ДНК из периферической крови беременной женщины; секвенирование библиотеки для секвенирования с целью получения результата секвенирования. Результат секвенирования плода включает множество полученных при секвенировании данных. Нуклеотидную последовательность в заданной области генома определяют посредством использования скрытой марковской модели на основании результата секвенирования последовательностей плода в сочетании с генетической информацией о родственнике с помощью алгоритма Витерби. Система состоит из аппарата конструирования библиотеки, секвенатора и анализатора. Использование изобретений позволяет произвести генотипирование с высокой точностью. 2 н. и 12 з.п. ф-лы, 2 ил., 1 табл., 1 пр.</abstract><oa>free_for_read</oa></addata></record>
fulltext fulltext_linktorsrc
identifier
ispartof
issn
language eng ; rus
recordid cdi_epo_espacenet_RU2597981C2
source esp@cenet
subjects BEER
BIOCHEMISTRY
CHEMISTRY
COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR
CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL ORENZYMOLOGICAL PROCESSES
ENZYMOLOGY
INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTEDFOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEICACIDS OR MICROORGANISMS
METALLURGY
MICROBIOLOGY
MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
PHYSICS
PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS
SPIRITS
VINEGAR
WINE
title METHOD AND SYSTEM FOR DETERMINING NUCLEOTIDE SEQUENCE IN GIVEN REGION OF FOETAL GENOME
url https://sfx.bib-bvb.de/sfx_tum?ctx_ver=Z39.88-2004&ctx_enc=info:ofi/enc:UTF-8&ctx_tim=2024-12-23T01%3A59%3A17IST&url_ver=Z39.88-2004&url_ctx_fmt=infofi/fmt:kev:mtx:ctx&rfr_id=info:sid/primo.exlibrisgroup.com:primo3-Article-epo_EVB&rft_val_fmt=info:ofi/fmt:kev:mtx:patent&rft.genre=patent&rft.au=GE%20KHuejtszyuan&rft.date=2016-09-20&rft_id=info:doi/&rft_dat=%3Cepo_EVB%3ERU2597981C2%3C/epo_EVB%3E%3Curl%3E%3C/url%3E&disable_directlink=true&sfx.directlink=off&sfx.report_link=0&rft_id=info:oai/&rft_id=info:pmid/&rfr_iscdi=true