COMBINATORIAL METHOD FOR OBTAINING DNA-APTAMER THROMBIN INHIBITORS AND APTAMER OLIGONUCLEOTIDES (VERSIONS)

FIELD: biotechnologies.SUBSTANCE: method for modular design of DNA aptamers capable of specific and high-affinity binding of thrombin, which have stabilised basic substructure, provides for assembly of their structure by modelling using a combination of three structural modules containing a quadruplex nucleic acid module, a duplex nucleic acid module and a nucleic acid module that binds them and has a non-canonical structure by determining tertiary structure with a spectral circular dichroism method with confirmation of the fact of formation of more stable G-quadruplex that is different from quadruplex structure of initial structural quadruplex module.EFFECT: application of a modular design method allows improving assembly efficiency of antithrombin DNA-aptamers having increased stability under physiological conditions.4 cl, 7 dwg, 3 ex Группа изобретений относится к области биотехнологии. Способ модульного конструирования ДНК аптамеров, способных специфически и высокоаффинно связывать тромбин, имеющих стабилизированную основную субструктуру, предусматривает сборку их структуры моделированием из комбинации трех структурных модулей, содержащих квадруплексный модуль нуклеиновой кислоты, дуплексный модуль нуклеиновой кислоты и соединяющий их модуль нуклеиновой кислоты, имеющий неканоническую структуру, путем определения третичной структуры его спектральным методом кругового дихроизма с подтверждением факта образования более стабильного G-квадруплекса, отличного от квадруплексной структуры исходного структурного квадруплексного модуля. Использование способа модульного конструирования позволяет повысить эффективность сборки антитромбиновых ДНК-аптамеров обладающих повышенной стабильностью при физиологических условиях. 4 н.п. ф-лы, 7 ил., 3 пр.