METODO PARA LA CARACTERIZACION DE POLIPEPTIDOS QUE SE UNEN A COMPLEJOS DE PEPTIDO.MHC

La presente invencion concierne a un metodo para la caracterizacion de polipeptidos que se unen a complejos de peptido:MHC, p. ej. mediante espectrometria de masas y un analisis del espacio peptidico reconocido, es decir, con el fin de identificar peptidos que puedan ser unidos en el contexto de su presentacion por el MHC, y aquellos que no puedan serlo. Tambien se refiere a un metodo para caracterizar la union de una molecula polipeptidica, que comprende al menos un dominio definido de union a peptido ("polipeptido de union a pMHC") a un peptido ("peptido diana") de un complejo de peptido:MHC, el cual comprende: a) facilitar una muestra que comprenda al menos un complejo de peptido:MHC que ha de ser analizada, b) la puesta en contacto de dicha muestra con dicha molecula polipeptidica, ("polipeptido de union a pMHC") y posibilitar que al menos un citado dominio de union a peptido de dicha molecula polipeptidica se una a como minimo un citado complejo de peptido:MHC, c) aislamiento como minimo de un citado complejo de peptido:MHC unido a, como minimo, un citado dominio de union a peptido, y d) identificacion de dicho peptido que esta formando parte de como minimo un complejo de peptido:MHC citado que se ha aislado en el paso c), y de ese modo identificacion de la union de la citada molecula polipeptidica a dicho peptido de como minimo un complejo de peptido:MHC citado The present invention relates to a method for the characterization of peptide:MHC binding polypeptides, e.g. by mass spectrometry and an analysis of the recognized peptide space, i.e. in order to identify peptides that can be bound in the context of their presentation by MHC, and those who cannot be bound.