METHODS AND SYSTEMS FOR DETERMINING ANCESTRAL RELATEDNESS

The present disclosure provides methods of estimating a degree of ancestral relatedness between individuals. In an aspect, a method comprises receiving haplotype data comprising genetic markers shared among a population of individuals; dividing the haplotype data into segments based on the genetic markers; for each of the population of test individuals: (i) based on the genetic markers, matching segments of the haplotype data that are identical-by-descent between two individuals, (ii) for each of the matched segments: dividing the matched segment into discrete genomic intervals, scoring each of the discrete genomic intervals based on a degree of matching within or between the individuals, correcting the scores for consistency, and (iii) calculating a weighted sum over the discrete genomic intervals of the matched segment, based on the corrected scores and assigned weights; and (d) estimating the degree of ancestral relatedness between the individuals based on the weighted sums of the matched segments. La presente divulgación proporciona métodos para estimar un grado de relación ancestral entre individuos. En un aspecto, un método comprende recibir datos de haplotipo que comprenden marcadores genéticos compartidos entre una población de individuos; dividir los datos de haplotipo en segmentos con base en los marcadores genéticos; para cada una de la población de individuos de prueba: (i) con base en los marcadores genéticos, hacer coincidir segmentos de los datos de haplotipo que son idénticos por descendencia entre dos individuos, (ii) para cada uno de los segmentos coincidentes: dividir el segmento coincidente en intervalos genómicos discretos, puntuar cada uno de los intervalos genómicos discretos con base en un grado de coincidencia dentro o entre los individuos, corregir las puntuaciones para consistencia, y (iii) calcular una suma ponderada sobre los intervalos genómicos discretos del segmento coincidente, con base en las puntuaciones corregidas y factores de ponderación asignados; y (d) estimar el grado de relación ancestral entre los individuos con base en las sumas ponderadas de los segmentos coincidentes.