SYSTEMS AND METHODS FOR FACILITATING CLONE SELECTION

A method for facilitating clone selection includes generating time-sequence images of a well containing a medium, including a first image and a later, second image. The method also includes detecting, by one or more processors analyzing the first image, one or more candidate objects depicted in the...

Ausführliche Beschreibung

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Bibliographische Detailangaben
Hauptverfasser: MILNE Graham F, WANG Tony Y, LE Kim H, YUAN Yu, TAN Glenn
Format: Patent
Sprache:eng ; spa
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Beschreibung
Zusammenfassung:A method for facilitating clone selection includes generating time-sequence images of a well containing a medium, including a first image and a later, second image. The method also includes detecting, by one or more processors analyzing the first image, one or more candidate objects depicted in the first image, and, for each of the candidate objects, determining whether the object is a single cell by analyzing an image of the object using a convolutional neural network. The method further includes detecting, by analyzing the second image with the processor(s), a cell colony depicted in the second image, and determining, by the processor(s), whether the colony was formed from only one cell based at least on whether each candidate object was determined to be a single cell. The method further includes generating, by the processor(s), output data indicating whether the colony was formed from only one cell. Un método para facilitar la selección de clones incluye generar imágenes de secuencia de tiempo de un pocillo que contiene un medio, que incluyen una primera imagen y una segunda imagen posterior. El método también incluye detectar, por uno o más procesadores que analizan la primera imagen, uno o más objetos candidatos representados en la primera imagen y, para cada uno de los objetos candidatos, determinar si el objeto es una célula individual analizando una imagen del objeto usando una red neuronal convolucional. El método incluye adicionalmente detectar, analizando la segunda imagen con el procesador o procesadores, una colonia de células representada en la segunda imagen, y determinar, por el procesador o procesadores, si la colonia se formó a partir de únicamente una célula basándose al menos en si se determinó que cada objeto candidato era una célula individual. El método incluye adicionalmente generar, por el procesador o procesadores, datos de salida que indican si la colonia se formó a partir de únicamente una célula.