HAPLOTYPES ASSOCIATED WITH IMPROVED STACKED TRAIT PERFORMANCE IN TRANSGENIC PLANTS

The present invention provides methods and compositions for the identification and selection of loci modulating phenotypic expression of an herbicide tolerance trait in plant breeding. In addition, methods are provided for screening germplasm entries for the performance and expression of this trait. La presente invención se refiere a un método para identificar una planta de soya transgérnica que comprende un genotipo asociado con la tolerancia reproducida al glifosato, el método se caracteriza porque comprende: (a) marcar por lo menos una planta transgénica en una población de plantas de soya transgénica que se han expuesto a dicamba para la tolerancia a dicamba, dichas plantas tiene un transgen que confiere resistencia a dicamba; (b) seleccionar una panta transgénica que exhiba tolerancia a dicamba, y ( c) genotipar la planta de soya seleccionada con respecto a por lo menos un marcado de ácido nucleíco polimórfico en cada una de por lo menos dos regiones genómicas del grupo de enlace L seleccionadas de: i) una primera región genómica del grupo de enlace L flanqueada por los loci M0205928 (SEQ ID NO: 4) y M0129138 (SEQ ID NO: 6), en donde la región comprende el locus de M0101724 (SEQ ID NO:5); (ii) una segunda región genómica del grupo de enlace L que está flanqueada por los loci BU551363 (SEQ ID NO: 9) y BU765955 (SEQ ID NO: 12) , en donde la región comprende los loci MO205350 (SEQ ID NO: 10) Y MO102027 (SEQ ID NO:11), (iii) una tercer región genómica del grupo de enlace L que está flanqueada por los loci BU55345 (SEQ ID NO:7) y M0114388 (SEQ ID O: 8), en donde la región comprende el locus NGMAX008197032 (SEQ ID NO: 52); identificando de tal modo una planta de soya transgénica que comprende un genotipo asociado con la tolerancia reproductiva a glifosato.