METHOD FOR DESIGNING HIGHLY IMMUNOGENIC MIMOTOPE AND DEVICE USING THE SAME

본 발명은 면역원성이 높은 유사체를 디자인하는 방법 및 이를 이용한 장치에 관한 것이다. 본 발명에 따른 면역원성이 높은 유사체를 디자인하는 방법은 환자의 암세포에만 존재하는 아미노산의 변이를 추출하는 단계, 상기 변이된 아미노산 중 면역원성이 높은 네오에피토프를 후보로 선택하고, 상기 환자가 보유한 HLA(human leukocyte antigen) 대립 유전자 타입(allele type) 및 T-세포 수용체 서열을 추출하는 단계, 병원체(pathogen) 펩티드 중 상기 선택한 네오에피토프 후보와 서열이 가장 유사한 병원체 펩티...

Ausführliche Beschreibung

Gespeichert in:
Bibliographische Detailangaben
Hauptverfasser: CHUNG OK SUNG, LEE HWANG YEOL, CHO YUN SUNG, JUN JE HOON
Format: Patent
Sprache:eng ; kor
Schlagworte:
Online-Zugang:Volltext bestellen
Tags: Tag hinzufügen
Keine Tags, Fügen Sie den ersten Tag hinzu!
Beschreibung
Zusammenfassung:본 발명은 면역원성이 높은 유사체를 디자인하는 방법 및 이를 이용한 장치에 관한 것이다. 본 발명에 따른 면역원성이 높은 유사체를 디자인하는 방법은 환자의 암세포에만 존재하는 아미노산의 변이를 추출하는 단계, 상기 변이된 아미노산 중 면역원성이 높은 네오에피토프를 후보로 선택하고, 상기 환자가 보유한 HLA(human leukocyte antigen) 대립 유전자 타입(allele type) 및 T-세포 수용체 서열을 추출하는 단계, 병원체(pathogen) 펩티드 중 상기 선택한 네오에피토프 후보와 서열이 가장 유사한 병원체 펩티드를 선정하는 단계, 상기 선정한 병원체 펩티드와 상기 선택한 네오에피토프 후보의 차이가 나는 아미노산 서열 영역을 정의하는 단계, 상기 정의된 아미노산 서열 영역과 관련하여 모든 경우의 수에 대해 변형된 펩티드 조합을 생성하는 단계, 상기 네오에피토프 후보의 펩티드와 상기 서열 변경된 펩티드의 서열 유사성을 측정하는 단계, 상기 모든 경우의 수에 대해 생성한 변형된 펩티드 조합의 면역원성을 예측하는 단계, 상기 환자의 암세포에만 존재하는 네오에피토프의 면역원성을 예측한 값, 상기 변형된 펩티드 조합의 면역원성을 예측한 값, 및 상기 측정한 서열 유사성을 측정한 값에 기초해 상기 변형된 펩티드 조합의 효율성을 측정하는 단계, 상기 측정한 변형된 펩티드 조합의 효율성에 기초해 면역원성이 클 것으로 예상되는 유사체를 디자인하는 단계를 포함할 수 있다.