염기 호출을 위한 전문 신호 프로파일러

시스템을 개시한다. 시스템은 메모리 및 런타임 로직을 포함한다. 메모리는 복수의 전문 신호 프로파일러를 저장한다. 복수의 전문 신호 프로파일러 내의 각각의 전문 신호 프로파일러는 특정 분석물 클래스에서 분석물에 대해 검출되고 특정 훈련 데이터 세트에서 특징지어지는 특정 신호 프로파일에서 시퀀싱된 신호의 신호 대 잡음비를 최대화하도록 훈련된다. 메모리에 액세스하는 런타임 로직은, 염기 호출 동작 동안 각각의 분석물 클래스 내의 분석물에 대해 검출된 각각의 신호 프로파일에서 시퀀싱된 신호에 복수의 전문 신호 프로파일러 내의 각각의 전문...

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Bibliographische Detailangaben
Hauptverfasser: KAGALWALLA ABDE ALI HUNAID, VIECELI JOHN S, UDPA NITIN, OJARD ERIC JON, PARNABY GAVIN DEREK, MEHIO RAMI
Format: Patent
Sprache:kor
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Beschreibung
Zusammenfassung:시스템을 개시한다. 시스템은 메모리 및 런타임 로직을 포함한다. 메모리는 복수의 전문 신호 프로파일러를 저장한다. 복수의 전문 신호 프로파일러 내의 각각의 전문 신호 프로파일러는 특정 분석물 클래스에서 분석물에 대해 검출되고 특정 훈련 데이터 세트에서 특징지어지는 특정 신호 프로파일에서 시퀀싱된 신호의 신호 대 잡음비를 최대화하도록 훈련된다. 메모리에 액세스하는 런타임 로직은, 염기 호출 동작 동안 각각의 분석물 클래스 내의 분석물에 대해 검출된 각각의 신호 프로파일에서 시퀀싱된 신호에 복수의 전문 신호 프로파일러 내의 각각의 전문 신호 프로파일러를 적용함으로써 염기 호출 동작을 실행하도록 구성된다. We disclose a system. The system comprises a memory and a runtime logic. The memory stores a plurality of specialist signal profilers. Each specialist signal profiler in the plurality of specialist signal profilers is trained to maximize signal-to-noise ratio of sequenced signals in a particular signal profile detected for analytes in a particular analyte class and characterized in a particular training data set. The runtime logic, having access to the memory, is configured to execute a base calling operation by applying respective specialist signal profilers in the plurality of specialist signal profilers to sequenced signals in respective signal profiles detected for analytes in respective analyte classes during the base calling operation.