method of predicting protein-ligand binding affinity

The present invention relates to a method for predicting the binding strength between protein and ligand, which is performed by a computing device including at least one processor. The method for predicting the binding strength between protein and ligand comprises the steps of: computing a chemical environment vector which numerically represents the chemical environment of a central atom; computing a feature vector based on the chemical environment vector; and predicting the binding strength based on the feature vector using a prediction model. The chemical environment vector is computed based on weights depending on the type of the central atom. 본 개시는 단백질과 리간드 간의 결합력을 예측하는 것을 해결과제로 하는, 적어도 하나의 프로세서를 포함하는 컴퓨팅 장치에 의해 수행되는, 단백질(protein)과 리간드(ligand) 간의 결합력을 예측하는 방법으로서, 중심 원자의 화학적 환경을 수치적으로 표현하는 화학적 환경 벡터를 연산하는 단계, 상기 화학적 환경 벡터를 기초로 특징 벡터를 연산하는 단계, 및 예측 모델을 사용하여, 상기 특징 벡터를 기초로 결합력을 예측하는 단계를 포함하되, 상기 화학적 환경 벡터는 상기 중심 원자의 종류에 의존하는 가중치를 기초로 연산 되는 방법에 관한 것이다.