cox1 Method for identification of varieties in Pyropia yezoensis by using the structural variation of mitochondrial cox1 gene

The present invention relates to a method for identifying the varieties of Pyropia yezoensis native to Korea. In particular, the method comprises the steps of: (A) by using a genomic DNA isolated from Pyropia yezoensis as a template, using a primer matching a sequence of the third exon e3 among five exons constituting a mitochondrial cox1 gene of the Pyropia yezoensis, and a primer set matching a complementary sequence of the fourth exon e4, to perform PCR on the intron i3 of the mitochondrial cox1 gene of the Pyropia yezoensis; (B) confirming amplification of the intron i3 in an amplification product; and (C) if the i3 is not amplified, determining the Pyropia yezoensis as a native variety. According to the present invention, as an active provision for the variety protection act, the method can be used to accurately identify seaweeds native to Korea, and in collaboration with the breeding technology, can be used in the development of new varieties derived from the native varieties, to effectively reduce the royalty fees being paid for foreign varieties, and further to generate royalty revenues through exportation of new varieties derived from the native varieties. 본 발명은, (A) 방사무늬김에서 분리된 게놈 DNA를 주형으로 하고, 5개의 엑손으로 구성된 방사무늬김의 미토콘드리아1 유전자의 세 번째 엑손 e3 서열에 매칭되는 프라이머와, 네 번째 엑손 e4의 상보서열에서 매칭되는 프라이머 세트를 이용하여 상기 방사무늬김 미토콘드리아1 유전자의 인트론 i3에 대한 PCR을 수행하는 단계; (B) 상기 증폭산물에서 인트론 i3의 증폭을 확인하는 단계; 및 (C) i3이 증폭되지 않았으면 상기 방사무늬김을 자생품종으로 결정하는 단계;를 포함하는 방사무늬김의 한국산 자생품종 구별방법인 것을 특징으로 한다. 이러한 본 발명에 의하면, 품종보호제도에 적극적으로 대비하는 차원에서 국내 자생김을 정확히 식별하고 이에 육종기술을 추가하여 자생품종 유래의 신품종 개발에 활용할 수 있어 외국 품종에 대한 로열티 지급을 최대한 방지하고, 나아가 자생품종 유래의 신품종 수출을 통하여 로열티 수익을 창출하는데 기여할 수 있게 된다.