ERROR RECOVERY METHOD IN GENOME SEQUENCE ANALYSIS AND GENOME SEQUENCE ANALYSIS APPARATUS

The present invention relates to an error handling method in nucleotide sequence analysis, comprising the steps of: acquiring, by an analysis device, sequence information of a plurality of reads for a sample; generating, by the analysis device, a plurality of tasks for processing data using sequence...

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Hauptverfasser: HONG CHANG BUM, YOO WON SEOK, JANG JOON SIK
Format: Patent
Sprache:eng ; kor
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Beschreibung
Zusammenfassung:The present invention relates to an error handling method in nucleotide sequence analysis, comprising the steps of: acquiring, by an analysis device, sequence information of a plurality of reads for a sample; generating, by the analysis device, a plurality of tasks for processing data using sequence information of at least some of the plurality of reads; generating, by the analysis device, a hash value for the plurality of tasks based on sequence information input to each task; identifying, by the analysis device, a target task having the same hash value as a hash value of a specific task from among the pre-processed task group including tasks for which data processing is completed with respect to a specific task in which an error occurs among the plurality of tasks; and performing, by the analysis device, analysis by replacing an output value of the target task with an output value of the specific task. The present invention is to recover an error using the analyzed result when an error occurs in the analysis process. 염기 서열 분석에서의 오류 처리 방법은 분석장치가 샘플에 대한 복수의 리드(read)들의 서열 정보를 획득하는 단계, 상기 분석장치가 상기 복수의 리드들 중 적어도 일부 리드들의 서열 정보를 이용하여 데이터를 처리하는 복수의 태스크들을 생성하는 단계, 상기 분석장치가 상기 복수의 태스크들에 대하여 각 태스크에 입력되는 서열 정보를 기준으로 해시(hash)값을 생성하는 단계, 상기 분석장치가 상기 복수의 태스크들 중 오류가 발생한 특정 태스크에 대하여, 데이터 처리가 완료된 태스크들을 포함하는 기처리 태스크 그룹 중 상기 특정 태스크의 해시값과 동일한 해시값을 갖는 타깃 태스크를 확인하는 단계 및 상기 분석장치가 상기 타깃 태스크의 출력값을 상기 특정 태스크의 출력값으로 대체하여 분석을 수행하는 단계를 포함한다.