HYBRIDIZING ALL-LNA OLIGONUCLEOTIDES

To identify and provide binding pairs of single-stranded all-LNA oligonucleotides which, in the absence of a prior denaturation step, are capable of hybridizing, thereby forming duplex molecules with Watson-Crick base pairing as a binding pair in analyte detection assays under suitable assay conditions.SOLUTION: The present document shows hybridization experiments with pairs of entirely complementary ss-oligonucleotides which fail to form a duplex within a given time interval. The present report provides methods to identify such incompatible oligonucleotide pairs. In another aspect, the present report provides pairs of complementary ss-oligonucleotides which are capable of rapid duplex formation. The present report also provides methods to identify and select compatible oligonucleotide pairs. In yet another aspect, the present report provides use of compatible oligonucleotide pairs as binding partners in binding assays, e.g. receptor-based assays.SELECTED DRAWING: None 【課題】事前の変性工程なしにハイブリダイズすることができ、それにより適切なアッセイ条件下での分析物検出アッセイにおける結合対としてワトソン－クリック塩基対合で二本鎖分子を形成することができる一本鎖全ＬＮＡオリゴヌクレオチドの結合対の同定及び提供。【解決手段】本文書は、所与の時間間隔内で二本鎖を形成することができない、完全に相補的なｓｓ－オリゴヌクレオチドの対を用いたハイブリダイゼーション実験を示す。本報告は、そのような互換性のないオリゴヌクレオチド対を特定するための方法を提供する。別の態様では、本報告は、迅速な二本鎖形成が可能である相補的ｓｓ－オリゴヌクレオチドの対を提供する。本報告は、互換性のあるオリゴヌクレオチド対を特定及び選択する方法も提供する。更に別の態様では、本報告は、受容体ベースのアッセイ等の結合アッセイにおける結合パートナーとしての互換性オリゴヌクレオチド対の使用を提供する。【選択図】なし