METHOD OF QUANTIFYING PRODUCT IMPACT ON HUMAN MICROBIOME

To provide methods for providing high throughput quantitative analysis of impact on human microbiome.SOLUTION: A method for analyzing microbiome of a human, mammal or non-human/non-mammal includes the steps of: a. collecting at least one polymicrobial sample containing nucleic acid material (NA) from the human, mammal or non-human/non-mammal; b. adding spike-in control standards to the sample of step a; c. extracting NA from the microbial sample of step b; d. analyzing the sample of step c using shotgun metagenomic sequencing; e. calculating the cell numbers for each of the microbial organisms identified in step d; and f. mapping on 1:n basis each microbial species identified in step d with human and/or mammal health conditions or causes of such health conditions based on known clinical testing information.SELECTED DRAWING: Figure 2 【課題】ヒトマイクロバイオームへの影響をハイスループットで定量分析する方法を提供する。【解決手段】ヒト、哺乳動物、又は非ヒト／非哺乳動物のマイクロバイオームを分析するための方法であって、ａ．ヒト、哺乳動物、又は非ヒト／非哺乳動物から、核酸物質（ＮＡ）を含有する少なくとも１つの多微生物サンプルを収集するステップ、ｂ．スパイクイン対照標準をステップａのサンプルに添加するステップ、ｃ．ステップｂの微生物サンプルからＮＡを抽出するステップ、ｄ．ショットガンメタゲノム配列決定を使用してステップｃのサンプルを分析するステップ、ｅ．ステップｄで同定された微生物の各々について細胞数を計算するステップ、ｆ．ステップｄで同定された各微生物種と、ヒト及び／又は哺乳動物の健康状態若しくはこのような健康状態の原因とを、既知の臨床試験情報に基づいて１：ｎベースでマッピングするステップを含む方法とする。【選択図】図２