Métodos, sistemas y dispositivos para detectar e identificar microorganismos en muestras de cultivo microbiológicas

Un vaso (50) para medir una cantidad deseada de una muestra, comprendiendo el vaso (50): un recipiente (58) para recibir una muestra de cultivo en el mismo, teniendo el recipiente (58) un extremo abierto y un extremo cerrado; una tapa (52) configurada para conectarse con el extremo abierto del recipiente (58) en una conexión hermética a fluidos; una cesta (54) acoplada a la tapa (52) y que incluye al menos un depósito (64), estando la cesta (54) colocada entre el extremo abierto y el extremo cerrado del recipiente (58), el depósito (64) configurado para contener un volumen predeterminado de muestra en el mismo, la cesta (54) y el depósito (64) configurados de tal manera que el depósito (64) se llena cuando el vaso (50) se inclina desde una posición horizontal erguida y la muestra fluye desde el recipiente (58) hacia la cesta (54); y al menos un conjunto de agujas (56) conectados con la tapa (52), incluyendo el conjunto de agujas (56) una aguja (70) que se extiende dentro del depósito (64), en el que la aguja (70) está configurada para extraer selectivamente una muestra contenida en el depósito (64) y en el que la aguja (70) está configurada además para conectarse a un vial (100) para una transferencia biocontenida de la muestra desde el depósito (64) hasta el vial (100). Provided herein are methods, systems, and devices for detecting and/or identifying one or more specific microorganisms in a culture sample. Indicator particles, such as surface enhanced Raman spectroscopy (SERS)-active nanoparticles, each having associated therewith one or more specific binding members having an affinity for the one or more microorganisms of interest, can form a complex with specific microorganisms in the culture sample. Further, agitating magnetic capture particles also having associated therewith one or more specific binding members having an affinity for the one or more microorganisms of interest can be used to capture the microorganism-indicator particle complex and concentrate the complex in a localized area of an assay vessel for subsequent detection and identification. The complex can be dispersed, pelleted, and redispersed so that the culture sample can be retested a number of times during incubation so as to allow for real-time monitoring of the culture sample.