Procedimiento para el subtipado de tipos de linfoma por medio de perfiles de expresión

Un procedimiento para seleccionar una opción de tratamiento para un sujeto con linfoma difuso de linfocitos B grandes similares a linfocitos B activados (ABC DLBCL), un sujeto con linfoma difuso de linfocitos B grandes similares a linfocitos B del centro germinal (GCB DLBCL), un sujeto con linfoma p...

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Hauptverfasser: CONNORS, Joseph M, SMELAND, Erlend B, JAFFE, Elaine S, CHAN, Wing C, DELABIE, Jan, FU, Kai, WILLIAMS, Paul Michael, OTT, German, ROSENWALD, Andreas, BRAZIEL, Rita M, STAUDT, Louis M, RIMSZA, Lisa, CAMPO GUERRI, Elias, LIH, Chih-Jian, COOK, James Robert, WRIGHT, George W, TUBBS, Raymond, GASCOYNE, Randy D, SCOTT, David William, GREINER, Timothy C, WEISENBURGER, Dennis
Format: Patent
Sprache:spa
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Beschreibung
Zusammenfassung:Un procedimiento para seleccionar una opción de tratamiento para un sujeto con linfoma difuso de linfocitos B grandes similares a linfocitos B activados (ABC DLBCL), un sujeto con linfoma difuso de linfocitos B grandes similares a linfocitos B del centro germinal (GCB DLBCL), un sujeto con linfoma primario mediastínico de linfocitos B (PMBL), un sujeto con linfoma de Burkitt (BL) o un sujeto con linfoma de células del manto (MCL), que comprende las etapas de: (a) aislar un producto de expresión génica de una muestra de biopsia de un sujeto con linfoma; (b) obtener datos de expresión génica digital a partir del producto de expresión génica aislado, en el que los datos de expresión génica digital comprenden datos para genes en una firma de expresión génica, y en el que la firma de expresión génica comprende al menos uno de los genes enumerados en la tabla 2; (c) obtener opcionalmente datos de expresión génica digital de un primer y segundo conjunto de sondas de referencia, el segundo conjunto de sondas de referencia conocido para clasificar ABC DLBCL, GCB DLBCL, PMBL, BL o MCL; (d) generar un promedio ponderado de los niveles de expresión de los genes a partir de la firma de expresión génica para obtener de este modo un valor de firma de expresión génica; (e) calcular una puntuación predictiva basada en el valor de la firma de expresión génica usando la ecuación: **Fórmula** en la que yi es una puntuación predictiva, xi son los recuentos para el gen i para el conjunto de sondas i, el conjunto de sondas i es de la muestra que se está sometiendo a análisis, xj es el recuento para el gen j para el conjunto de sondas j, el conjunto de sondas j es el conjunto de genes de normalización de la muestra que se está sometiendo a prueba, hj es el peso de normalización para el conjunto de sondas j como se enumera en la tabla 4, ri es el recuento para el gen i para el conjunto de sondas i en el primer conjunto de sondas de referencia, 30 y gi es el recuento de gen i para el conjunto de sondas i en el segundo conjunto de sondas de referencia, siendo los términos matemáticos con ri y gi igual a cero si no se obtienen datos de expresión génica digital de un primer y segundo conjunto de sondas de referencia; (f) clasificar el sujeto como perteneciente a uno de los siguientes en base a la puntuación predictiva de (e): (i) ABC DLBCL, (ii) GCB DLBCL, (iii) PMBL, (iv) BL o (v) MCL; (g) seleccionar una opción de tratamiento para el sujeto basada en la clasificación del sujeto en (