Procedimiento para el subtipado de tipos de linfoma por medio de perfiles de expresión
Un procedimiento para seleccionar una opción de tratamiento para un sujeto con linfoma difuso de linfocitos B grandes similares a linfocitos B activados (ABC DLBCL), un sujeto con linfoma difuso de linfocitos B grandes similares a linfocitos B del centro germinal (GCB DLBCL), un sujeto con linfoma p...
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Format: | Patent |
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Zusammenfassung: | Un procedimiento para seleccionar una opción de tratamiento para un sujeto con linfoma difuso de linfocitos B grandes similares a linfocitos B activados (ABC DLBCL), un sujeto con linfoma difuso de linfocitos B grandes similares a linfocitos B del centro germinal (GCB DLBCL), un sujeto con linfoma primario mediastínico de linfocitos B (PMBL), un sujeto con linfoma de Burkitt (BL) o un sujeto con linfoma de células del manto (MCL), que comprende las etapas de: (a) aislar un producto de expresión génica de una muestra de biopsia de un sujeto con linfoma; (b) obtener datos de expresión génica digital a partir del producto de expresión génica aislado, en el que los datos de expresión génica digital comprenden datos para genes en una firma de expresión génica, y en el que la firma de expresión génica comprende al menos uno de los genes enumerados en la tabla 2; (c) obtener opcionalmente datos de expresión génica digital de un primer y segundo conjunto de sondas de referencia, el segundo conjunto de sondas de referencia conocido para clasificar ABC DLBCL, GCB DLBCL, PMBL, BL o MCL; (d) generar un promedio ponderado de los niveles de expresión de los genes a partir de la firma de expresión génica para obtener de este modo un valor de firma de expresión génica; (e) calcular una puntuación predictiva basada en el valor de la firma de expresión génica usando la ecuación: **Fórmula** en la que yi es una puntuación predictiva, xi son los recuentos para el gen i para el conjunto de sondas i, el conjunto de sondas i es de la muestra que se está sometiendo a análisis, xj es el recuento para el gen j para el conjunto de sondas j, el conjunto de sondas j es el conjunto de genes de normalización de la muestra que se está sometiendo a prueba, hj es el peso de normalización para el conjunto de sondas j como se enumera en la tabla 4, ri es el recuento para el gen i para el conjunto de sondas i en el primer conjunto de sondas de referencia, 30 y gi es el recuento de gen i para el conjunto de sondas i en el segundo conjunto de sondas de referencia, siendo los términos matemáticos con ri y gi igual a cero si no se obtienen datos de expresión génica digital de un primer y segundo conjunto de sondas de referencia; (f) clasificar el sujeto como perteneciente a uno de los siguientes en base a la puntuación predictiva de (e): (i) ABC DLBCL, (ii) GCB DLBCL, (iii) PMBL, (iv) BL o (v) MCL; (g) seleccionar una opción de tratamiento para el sujeto basada en la clasificación del sujeto en ( |
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