Method for the detection of single nucleotid polymorphisms (SNP) of genes of drug metabolism and test system for performing such a method

Detecting single-nucleotide polymorphisms (SNP) in human CYP2 genes (A) using any of 58 specified primers and/or probes (ON), is new. Independent claims are also included for: (1) test kit for the new method; and (2) ON, and partial sequences of plasmid DNA, also their variants with analogous properties. Die Erfindung betrifft ein vereinfachtes Verfahren zum Nachweis von SNP in Cytochrom P450 (CYP)-Genen des Menschen und ein Test Kit mit folgenden Komponenten: 1. Neu entwickelte synthetische Oligonukleotide, die geeignet sind, Genabschnitte in Genen des Arzneimittelmetabolismus mit Hilfe der "DNA Polymerase Chain Reaction" Technologie (PCR) isoformspezifisch (IS-PCR) aus genomischer Leukozyten-DNA zu amplifizieren, 2. Komponenten, die es ermöglichen, einzelsträngig biotinierte IS-PCR Produkte auf Streptavidin beschichteten Mikrotiterplatten (SA-MTP) selektiv, thermostabil und einzelsträngig zu immobilisieren, 3. testoptimierte, allelspezifische, Fluoresceinisothiocyanat (FITC) markierte synthetische Oligonukleotide, die durch Hybridisierung, nachfolgende stringente Waschung und anschließende Detektion mittels Fluorometrie bzw. Photometrie eine sichere Genotypisierung der immobilisierten Amplifikationsprodukte (Amplikons) gewährleisten, oder alternativ dazu, 4. Streptavidin beschichtete Glasobjektträger (SA-Chip) auf denen biotinierte, isoformspezifische, synthetische Oligonukleotide immobilisiert sind, welche mit partiell einzelsträngigen PCR Produkten hybridisiert werden, die durch diskriminierende Verlängerung eines allelspezifischen, endständig FITC markierten Oligonukleotides mittels Taq DNA Polymerase erzeugt wurden und durch nachfolgende stringente Waschung und anschließende Detektion mittels Fluorometrie bzw. Photometrie eine sichere Genotypisierung der hybridisierten Amplikons gewährleisten, 5. neu entwickelte synthetische Oligonukleotide, die geeignet sind, an PCR amplifizierten CYP Genabschnitten, mit Hilfe der "Taq DNA Ligase detection reaction" Technologie (LDR) SNP spezifische, mit einer synthetischen Erkennungssequenz (ZIP Code) versehene, Oligonukleotide diskriminierend mit daran anschließenden 3' FITC markierten Oligonukleotiden zu ligieren, 6. 3' Biotin markierte, auf Streptavidin beschichteten Polycarbonatobjektträgern (PC-Chips) immobilisierte, revers komplementäre, synthetische Oligonukleotide, die es ermöglichen, die Ligationsprodukte anhand ihrer ZIP Code Sequenz allespezifisch zu hybridisieren und anschließend mittels Fluorometrie bz