Graphische Benutzeroberfläche eines Computers mit genomischem Arbeitsablauf

Es sind Verfahren und Computereinrichtungen offenbart, um Genomdaten in zumindest teilweise automatisierten Arbeitsabläufen von Modulen zu verarbeiten. Ein Verfahren umfasst Folgendes: Angeben einer Quelle von der eine oder mehrere Nukleotidsequenzen erhalten werden können; Auswählen eines oder mehrerer Module zum Verarbeiten von Daten, einschließlich mindestens eines Moduls zum Verarbeiten der einen oder mehreren Nukleotidsequenzen; Darstellen von graphischen Komponenten in einer graphischen Benutzeroberfläche, die die Quelle und das oder die Module als Knoten in einem Arbeitsbereich repräsentieren; Empfangen von Eingaben über die graphische Benutzeroberfläche, die die Quelle und das oder die Module als ein Arbeitsablauf anordnen, der eine Abfolge von Knoten umfasst, wobei die Abfolge für jedes bestimmte Modul anzeigt, dass eine Ausgabe von entweder der Quelle oder einem anderen bestimmten Modul in das bestimmte Modul eingegeben werden soll; Erzeugen einer Ausgabe für den Arbeitsablauf, gestützt auf die eine oder mehreren Nukleotidsequenzen, indem jedes Modul in einer Reihenfolge ausgeführt wird, die durch die Abfolge angezeigt ist. Methods and computer apparatuses are disclosed for processing genomic data in at least partially automated workflows of modules. A method comprises: specifying a source from which nucleic acid sequence(s) are to be obtained; selecting module(s) for processing data, including at least one module for processing the one or more nucleic acid sequences; presenting, in a graphical user interface, graphical components representing the source and the module(s) as nodes within a workspace; receiving, via the graphical user interface, inputs arranging the source and the module(s) as a workflow comprising a series of nodes, the series indicating, for each particular module, that output from one of the source or another particular module is to be input into the particular module; generating an output for the workflow based upon the nucleic acid sequence(s) by processing each module in an order indicated by the series.