Método para determinar identidad celular desde una muestra biológica compleja por pcr-hrm y análisis matemático
En esta invención se presenta un método para determinar la identidad celular desde una muestra biológica que se encuentra en una matriz que comprende proporcionar una muestra biológica, realizar opcionalmente un paso de separación celular, extraer el ADN de interés, efectuar una PCR para amplificar...
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Format: | Patent |
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Zusammenfassung: | En esta invención se presenta un método para determinar la identidad celular desde una muestra biológica que se encuentra en una matriz que comprende proporcionar una muestra biológica, realizar opcionalmente un paso de separación celular, extraer el ADN de interés, efectuar una PCR para amplificar al menos una región genómica utilizando un conjunto de partidores de amplificación de amplio rango, realizar una HRM de los amplicones, convertir los datos generados mediante análisis matemático y usar dichos datos para determinar identidad celular
The invention relates to a method for determining cellular identity from a biological sample in a matrix, which comprises providing a biological sample suspected of containing cells or microorganisms; carrying out an optional step of cellular separation of the sample; extracting DNA from the sample and carrying out a polymerase chain reaction (PCR) to amplify at least one genomic region, using a set of broad-taxonomic-range amplification primers; producing a high-resolution melt (HRM) curve of the amplicons generated by the PCR of the previous step; converting the generated data by means of mathematical transformation; using the mathematically transformed data as inputs for machine learning algorithms to determine cellular identity; and comparing the data of the suspected biological sample with a database of know microorganisms to identify cells. |
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