OFF-TARGET PREDICTION METHOD FOR ANTIGEN-RECOGNITION MOLECULES BINDING TO MHC-PEPTIDE TARGETS

Computational systems and methods for predicting amino acid position(s) within a target peptide presented in a complex with a major histocompatibility complex (MHC) molecule (MHC- target peptide complex), the amino acid position(s) being involved in interacting with an antigen-recognition molecule that recognizes said MHC -target peptide complex, are presented herein. Computational systems and methods for estimating a number of off-target peptide(s) for an antigen-recognition molecule that recognizes a target peptide presented in a complex with a major histocompatibility complex (MHC) molecule (MHC -target peptide complex) is presented herein. Computational systems and methods for ranking potential target peptides to mitigate off-target toxicity are presented herein. Such computational systems and methods can streamline development of effective, well tolerated antigen-recognition molecules to treat diseases. La présente invention concerne des systèmes informatiques et des procédés pour prédire une ou plusieurs positions d'acides aminés au sein d'un peptide cible présenté dans un complexe comportant une molécule de complexe majeur d'histocompatibilité (CMH) (complexe CMH-peptide cible), la ou les positions d'acides aminés étant impliquées dans l'interaction avec une molécule de reconnaissance d'antigène qui reconnaît ledit complexe CMH-peptide cible. L'invention concerne également des systèmes informatiques et des procédés pour estimer un nombre de peptides hors cible d'une molécule de reconnaissance d'antigène qui reconnaît un peptide cible présenté dans un complexe comportant une molécule de complexe majeur d'histocompatibilité (CMH) (complexe CMH-peptide cible). L'invention concerne également des systèmes informatiques et des procédés pour classer des peptides cibles potentiels pour atténuer la toxicité hors cible. De tels systèmes informatiques et procédés peuvent rationaliser le développement de molécules de reconnaissance d'antigène efficaces, bien tolérées, pour traiter des maladies.