ANTIBODY COMPETITION MODEL USING AFFINITIES OF HIDDEN VARIABLES

Embodiments derive hidden variables based on antibody competition data to discover binding patterns. For example, antibody competition data for a plurality of antibodies and an antigen can be received, where the antibody competition data includes data values indicative of pairwise competition between antibodies. The antibody competition data can be processed to generate training data. Using the training data and an optimization engine, a plurality of hidden variables and affinity scores for the hidden variables can be derived, where affinity scores for the hidden variables are derived for each antibody and the hidden variables represent competition factors for the antigen that cause competition among the antibodies. Des modes de réalisation permettent de déduire des variables cachées sur la base de données de compétition d'anticorps pour découvrir des motifs de liaison. Par exemple, des données de compétition d'anticorps pour une pluralité d'anticorps et un antigène peuvent être reçues, les données de compétition d'anticorps comprenant des valeurs de données indicatives d'une compétition par paires entre des anticorps. Les données de compétition d'anticorps peuvent être traitées pour générer des données d'apprentissage. En utilisant les données d'apprentissage et un moteur d'optimisation, une pluralité de variables cachées et des scores d'affinité pour les variables cachées peuvent être déduits, les scores d'affinité pour les variables cachées étant déduits pour chaque anticorps et les variables cachées représentant des facteurs de compétition pour l'antigène qui provoquent une compétition entre les anticorps.