METHODS FOR IMPROVING NUCLEIC ACID CLUSTER CLONALITY

A method for seeding and amplifying target nucleic acids derived from a sample in a cluster at a site on a surface of a substrate includes retaining at least a portion of the target nucleic acids in an inactive form that cannot seed to provide a relatively low concentration of active form target nuc...

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Bibliographische Detailangaben
Hauptverfasser: SKINNER, GARY MARK, HE, MOLLY, EVANS, GERAINT, BOUTELL, JONATHAN, PREVITE, MICHAEL, GORMLEY, NIALL, KELLINGER, MATTHEW W
Format: Patent
Sprache:eng ; fre
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Beschreibung
Zusammenfassung:A method for seeding and amplifying target nucleic acids derived from a sample in a cluster at a site on a surface of a substrate includes retaining at least a portion of the target nucleic acids in an inactive form that cannot seed to provide a relatively low concentration of active form target nucleic acids available for seeding. As the active form target nucleic acids seed on the surface of the substrate, they may be amplified. Because the concentration of active form target nucleic acids is low, the likelihood is low that a second active form target nucleic acid will seed at the same site within the same cluster before the first active form target nucleic acid is sufficiently amplified to dominate. Accordingly, the likelihood that the cluster will pass filters is increased relative to traditional seeding and amplification methods employing a higher concentration of active form target nucleic acids. Procédé d'ensemencement et d'amplification d'acides nucléiques cibles dérivés d'un échantillon dans un amas à un site sur une surface d'un substrat comprenant la rétention d'au moins une partie des acides nucléiques cibles sous une forme inactive ne pouvant pas s'ensemencer pour fournir une concentration relativement faible d'acides nucléiques cibles sous forme active disponibles pour l'ensemencement. Lorsque les acides nucléiques cibles de forme active sont ensemencés à la surface du substrat, ils peuvent être amplifiés. Comme la concentration d'acides nucléiques cibles de forme active est faible, la probabilité est faible qu'un deuxième acide nucléique cible de forme active germe au même site dans le même groupe avant que le premier acide nucléique cible de forme active soit suffisamment amplifié pour prédominer. Par conséquent, la probabilité que le groupe passe les filtres est accrue par rapport aux procédés traditionnels d'ensemencement et d'amplification employant une concentration plus élevée d'acides nucléiques cibles de forme active.