GENERATION OF OPTIMIZED NUCLEOTIDE SEQUENCES

A method for generated an optimized nucleotide sequence is provided. The method comprises at least normalizing a codon usage table and selection of codons for a given amino acid sequence based on the usage frequency of the codons in the normalized codon usage table. The method may comprise generatin...

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Hauptverfasser: DIAS, ANUSHA, TRAN, KHANG ANH, DEROSA, FRANK
Format: Patent
Sprache:eng ; fre
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Beschreibung
Zusammenfassung:A method for generated an optimized nucleotide sequence is provided. The method comprises at least normalizing a codon usage table and selection of codons for a given amino acid sequence based on the usage frequency of the codons in the normalized codon usage table. The method may comprise generating a list of a plurality of optimized nucleotide sequences encoding the amino acid sequence, filtering the list of optimized nucleotide sequences, synthesizing one or more optimized nucleotide sequence, and/or administering one or more synthesized optimized nucleotide sequence. Un procédé de génération d'une séquence nucléotidique optimisée est prévu. Le procédé consiste au moins à normaliser une table d'utilisation de codons et à sélectionner des codons pour une séquence d'acides aminés donnée sur la base de la fréquence d'utilisation des codons dans la table d'utilisation de codons normalisée. Le procédé peut consister à générer une liste d'une pluralité de séquences nucléotidiques optimisées codant pour la séquence d'acides aminés, à filtrer la liste de séquences nucléotidiques optimisées, à synthétiser une ou plusieurs séquences nucléotidiques optimisées et/ou à administrer une ou plusieurs séquences nucléotidiques optimisées synthétisées.