METHODS AND SYSTEMS FOR MOLECULAR DISEASE ASSESSMENT VIA ANALYSIS OF CIRCULATING TUMOR DNA

The present disclosure provides methods of assessing tumor status (e.g., progression, regression, recurrence, etc.) in a subject. In an aspect, a method for assessing tumor status (e.g., progression, regression, recurrence, etc.) of a subject may comprise: based on first and second WGS data of cfDNA molecules of a subject at different time points, determing (i) a first and second plurality of CNAs and (ii) a first and a second plurality of fragment lengths; processing the first and second plurality of CNAs to determine a CNA profile change; comparing the first and second plurality of fragment lengths to determine a fragment length profile change; determining a first or second tumor fraction of the subject at the first or second timepoint, based at least in part on the CNA profile change and the fragment length profile change; and detecting a tumor status of the subject based at least in part on the first or second tumor fraction. La présente invention concerne des procédés d'évaluation de l'état d'une tumeur (par exemple, la progression, la régression, la récurrence, etc.) chez un sujet. Selon un aspect, l'invention concerne un procédé pour évaluer l'état d'une tumeur (par exemple, la progression, la régression, la récurrence, etc.) chez un sujet qui peut comprendre les étapes de : sur la base de premières et secondes données WGS de molécules d'ADN libre circulant d'un sujet à différents instants, la détermination (i) d'une première et d'une seconde pluralité d'ANC et (ii) d'une première et d'une seconde pluralité de longueurs de fragment; le traitement de la première et de la seconde pluralité d'ANC pour déterminer un changement de profil d'ANC; la comparaison de la première et de la seconde pluralité de longueurs de fragment pour déterminer un changement de profil de longueur de fragment; la détermination d'une première ou d'une seconde fraction tumorale du sujet au premier ou au second instant, sur la base, au moins en partie, du changement de profil d'ANC et du changement de profil de longueur de fragment; et la détection d'un état d'une tumeur du sujet sur la base, au moins en partie, de la première ou de la seconde fraction tumorale.