METHOD OF DETECTING INFECTION WITH PATHOGENS CAUSING TUBERCULOSIS

The present invention refers to in vitro methods of detecting an infection with pathogens causing tuberculosis comprising the steps of (a) contacting a first aliquot of a sample of an individual with at least one antigen of a pathogen causing tuberculosis, b) incubating the first aliquot with the at least one antigen over a certain period of time, c) detecting in the first aliquot and in a second aliquot of the sample of the individual a marker or a combination of markers, e.g. Interferon gamma, CXCL10, ncTRIM69, using reverse transcription quantitative real-time polymerase chain reaction (RT-qPCR) or RNA Sequencing (RNA-Seq), and d) comparing the detected marker(s) in the first aliquot with the detected marker(s) in the second aliquot, wherein the second aliquot has not been incubated with the at least one antigen. In addition, the present invention refers to a kit for performing the methods according to the present invention. The present invention also refers to the use of the marker ncTRIM69, a primer for amplification of the marker ncTRIM69, and/or a probe for detecting the marker ncTRIM69 in an / n vitro method of diagnosing tuberculosis, in particular of detecting infection with pathogens causing tuberculosis. La présente invention concerne des procédés in vitro de détection d'une infection à pathogènes provoquant la tuberculose, ces procédés comprenant les étapes consistant à : a) mettre en contact une première aliquote d'un échantillon d'un individu avec au moins un antigène d'un pathogène provoquant la tuberculose ; b) faire incuber la première aliquote avec l'au moins un antigène pendant une certaine période de temps ; c) détecter, dans la première aliquote et dans une seconde aliquote de l'échantillon de l'individu, un marqueur à l'aide d'une réaction de transcriptase inverse-réaction en chaîne de la polymérase en temps réel quantitative (RT-q PCR) ou d'un séquençage d'ARN (ARN-séq) ; et d) comparer le(s) marqueur(s) détecté(s) dans la première aliquote avec le(s) marqueur(s) détecté(s) dans la seconde aliquote, la seconde aliquote n'ayant pas été incubée avec l'au moins un antigène. En outre, la présente invention concerne l'utilisation d'un kit d'exécution des procédés selon la présente invention. La présente invention concerne également l'utilisation du marqueur ncTRIM69, d'une amorce d'amplification du marqueur ncTRIM69, et/ou d'une sonde de détection du marqueur ncTRIM69 dans un procédé in vitro de diagnostic de la tuberculose, en particuli