CXCR3 AS EPIGENETIC MARKER FOR THE IDENTIFICATION OF INFLAMMATORY IMMUNE CELLS, IN PARTICULAR CD8+ MEMORY T CELLS

The present invention relates to a method, in particular an in vitro method, for specifically identifying the C-X-C motif chemokine receptor 3 (CXCR3) subpopulation of immune cells in a sample from a mammal comprising immune cells, in particular at least one of CD8+ effector and memory T cells, T helper (Th)1 cells and natural killer T (NKT) cells, comprising analyzing epigenetic modifications/properties of (including the methylation status) of at least one CpG position in the mammalian gene region for CXCR3 according to SEQ ID No. 1, wherein a demethylation or lack of methylation of said of at least one CpG position in said gene region is indicative for said CXCR3 specific subpopulation of immune cells in said sample, when compared to other immune cells, in particular for at least one of CD8+effector and memory T cells, T helper (Th)1 cells and natural killer T (NKT) cells. The analyses according to the invention can identify the above cells on an epigenetic level and distinguish them from all other cells in complex samples, such as, for example, other blood or immune cells. The present invention furthermore provides an improved method for quantifying the above cells, in particular in complex samples. The method can be performed without a step of purifying and/or enriching cells, preferably in whole blood and/or non-trypsinized tissue. La présente invention concerne une méthode, en particulier une méthode in vitro, pour identifier spécifiquement la sous-population de récepteur 3 de chimiokine à motif C-X-C (CXCR3) de cellules immunitaires dans un échantillon provenant d'un mammifère comprenant des cellules immunitaires, en particulier au moins un des lymphocytes T effecteurs et mémoires CD8 +, des lymphocytes T auxiliaires (Th)1, et des lymphocytes T tueurs naturels (NKT), comprenant l'analyse de modifications/propriétés épigénétiques (y compris l'état de méthylation) d'au moins une position CpG dans la région génique mammifère pour CXCR3 selon la SEQ ID No. 1, une déméthylation ou un manque de méthylation de ladite ou desdites positions CpG dans ladite région génique indiquant ladite sous-population spécifique de CXCR3 de cellules immunitaires dans ledit échantillon, par comparaison avec d'autres cellules immunitaires, en particulier pour au moins un des lymphocytes T effecteurs et mémoires CD8 +, des lymphocytes T auxiliaires (Th) 1 et des lymphocytes T tueurs naturels (NKT). Les analyses selon l'invention permettent d'identifier les cellules susmention