METHOD FOR DETERMINING CELL CLONALITY
The invention relates to a method for determining the clonality of a master cell bank (MCB) in which a transgene has been inserted. The method involves a combination of sequencing methodology and bioinformatic analysis, performed on multiple subclones originating from a common MCB, to establish a re...
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Format: | Patent |
Sprache: | eng ; fre |
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Zusammenfassung: | The invention relates to a method for determining the clonality of a master cell bank (MCB) in which a transgene has been inserted. The method involves a combination of sequencing methodology and bioinformatic analysis, performed on multiple subclones originating from a common MCB, to establish a reliable set of reference transgene insertion regions in one reference subclone, and corresponding sets of comparative transgene insertion regions in one or more other subclones originating from the same MCB. Based on the degree of congruity between reference and comparative transgene insertion regions, the MCB is determined to be either monoclonal or polyclonal.
L'invention concerne une méthode de détermination de la clonalité d'une banque cellulaire maîtresse MCB dans laquelle a été inséré un transgène. La méthode implique de combiner une méthodologie de séquençage et une analyse bioinformatique, exécutées sur de nombreux sous-clones provenant d'une MCB commune, afin d'établir un ensemble fiable de régions de référence d'insertion du transgène dans un sous-clone de référence, et d'ensembles correspondants de régions d'insertion du transgène comparées, situées dans un ou plusieurs autres sous-clones provenant de la même MCB. Sur la base du degré de congruence entre des régions d'insertion du transgène comparées et de référence, la MCB est définie comme étant monoclonale ou polyclonale. |
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