OMPG VARIANTS

The present disclosure provides variant OmpG polypeptides, compositions comprising the OmpG variant polypeptides, and methods for using the variant OmpG polypeptides as nanopores for determining the sequence of single stranded nucleic acids. The variant OmpG nanopores reduce the ionic current noise...

Ausführliche Beschreibung

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Bibliographische Detailangaben
Hauptverfasser: YANG, CHARLOTTE, HARRIS, CORISSA, TZITZILONIS, CHRISTOS, DALAL, DHRUTI, YANG, ALEXANDER, CECH, CYNTHIA, CRAIG, TIM, DIPIETRO, MATTHEW, JENSEN, LIV
Format: Patent
Sprache:eng ; fre
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Beschreibung
Zusammenfassung:The present disclosure provides variant OmpG polypeptides, compositions comprising the OmpG variant polypeptides, and methods for using the variant OmpG polypeptides as nanopores for determining the sequence of single stranded nucleic acids. The variant OmpG nanopores reduce the ionic current noise versus the parental OmpG polypeptide from which they are derived and thereby enable sequencing of polynucleotides with single nucleotide resolution. The reduced ionic current noise also provides for the use of these OmpG nanopore variants in other single molecule sensing applications, e.g., protein sequencing. La présente invention concerne des polypeptides variants d'OmpG, des compositions comprenant les polypeptides variants d'OmpG, et des procédés d'utilisation des polypeptides variants d'OmpG en tant que nanopores pour déterminer la séquence d'acides nucléiques simple brin. Les nanopores variants d'OmpG réduisent le bruit de courant ionique par rapport au polypeptide OmpG parental à partir duquel ils sont dérivés et, de ce fait, permettent le séquençage de polynucléotides avec une résolution en nucléotides individuels. Le bruit de courant ionique réduit permet également l'utilisation de ces variants de nanopores d'OmpG dans d'autres applications de détection de molécule unique, par exemple le séquençage de protéine.