A METHOD AND SYSTEM FOR AUTOMATED MICROBIAL COLONY COUNTING FROM STREAKED SAMPLE ON PLATED MEDIA

The present disclosure is directed to an automated method for evaluating growth on plated media, comprising: providing a culture media inoculated with a biological sample (202); incubating the inoculated culture media (204); following incubation, obtaining a first image of the inoculated media at a...

Ausführliche Beschreibung

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Hauptverfasser: MARCELPOIL, RAPHAEL RODOLPHE, WILES, TIMOTHY M
Format: Patent
Sprache:eng ; fre
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Beschreibung
Zusammenfassung:The present disclosure is directed to an automated method for evaluating growth on plated media, comprising: providing a culture media inoculated with a biological sample (202); incubating the inoculated culture media (204); following incubation, obtaining a first image of the inoculated media at a first time (206); after further incubation, obtaining a second image of the inoculated media at a second time (206); aligning the first image with the second image, such that the coordinates of a pixel in the second image are about the same as the coordinates of a corresponding pixel in the first image; comparing image features of the second image with image features of the first image; classifying image features of the second image as colony candidates based on image feature changes from the first time to the second time; for colony candidates determined to be from a common microorganism in the biological sample inoculated on the culture media, counting said colony candidates;and determining whether the number of counted colonies meets or exceeds the threshold count value stored in memory and indicative of significant growth. La présente invention se rapporte à un système imageur et à un procédé pour la détection, le comptage ou l'identification d'une prolifération microbienne. Une colonie peut être contrastée dans une image qui n'est pas optimale pour un autre type de colonie. Le système et le procédé créent un contraste à partir de l'ensemble du matériau disponible grâce à une transformation dans l'espace (différences spatiales), dans le temps (différences apparaissant au fil du temps pour une condition de capture donnée) et dans l'espace colorimétrique à l'aide d'informations d'entrée d'image au fil du temps afin de déterminer si la prolifération microbienne s'est produite pour un échantillon donné.