METHOD OF ESTIMATING THE AMOUNT OF A METHYLATED LOCUS IN A SAMPLE

A method of estimating the amount of a methylated locus is provided. In certain embodiments the method comprises: digesting a nucleic acid sample that contains both unmethylated and methylated copies of a genomic locus with an MspJI family member to produce a population of fragments that are in the...

Ausführliche Beschreibung

Gespeichert in:

Bibliographische Detailangaben
Hauptverfasser:	BANER, JOHAN, DAHL, CARL OSCAR FREDRIK, ERICSSON, OLOF JOHN
Format:	Patent
Sprache:	eng ; fre
Schlagworte:	BEER BIOCHEMISTRY CHEMISTRY COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL ORENZYMOLOGICAL PROCESSES ENZYMOLOGY MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEICACIDS OR MICROORGANISMS METALLURGY MICROBIOLOGY MUTATION OR GENETIC ENGINEERING PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS SPIRITS VINEGAR WINE
Online-Zugang:	Volltext bestellen
Tags:	Tag hinzufügen Keine Tags, Fügen Sie den ersten Tag hinzu!

Beschreibung
Zusammenfassung:	A method of estimating the amount of a methylated locus is provided. In certain embodiments the method comprises: digesting a nucleic acid sample that contains both unmethylated and methylated copies of a genomic locus with an MspJI family member to produce a population of fragments that are in the range of 20-40 nucleotides in length, ligating adaptor sequence A and adaptor sequence B to the respective ends of a target fragment of sequence X, and quantifying the amount of ligation products of formula A-X-B. A kit for performing the method is also provided. L'invention concerne un procédé d'estimation de la quantité d'un locus méthylé. Selon certains modes de réalisation, le procédé comprend : la digestion d'un échantillon d'acide nucléique contenant à la fois des copies non méthylées et méthylées d'un locus génomique avec un membre de la famille MspJI, afin de produire une population de fragments dans la plage de 20 à 40 nucléotides de longueur, la ligature d'une séquence d'adaptateur A et d'une séquence d'adaptateur B aux extrémités respectives d'un fragment cible de la séquence X, et la quantification de la quantité de produits de ligature de formule A-X-B. L'invention concerne également un kit destiné à mettre en uvre le procédé.