MICROBIAL POPULATION ANALYSIS

The present invention relates to a method of typing a microbiome for having a desirable or undesirable signature, comprising analyzing the composition of the population of microorganisms in said microbiome based on taxonomic variation in the DNA sequence of the microbial 16S23S rRNA internal transcribed spacer (ITS) regions in the genomic DNA of said microorganisms, wherein the sequences of conserved DNA regions comprised in the 16S and 23S rRNA sequences flanking said ITS region in the genome of said microorganisms comprise primer binding sites for amplification of said ITS regions. La présente invention concerne un procédé de typage d'un microbiome comme ayant une signature désirable ou indésirable, comprenant l'analyse de la composition de la population de micro-organismes dans ledit microbiome à partir de la variation taxonomique microbiome dans la séquence d'ADN des régions d'espaceur transcrit interne (ITS) de l'ARNr 16S-23S microbien dans l'ADN génomique desdits micro-organismes, les séquences de régions ADN conservées comprises dans les séquences d'ARNr 16S et 23S flanquant ladite région ITS dans le génome desdits micro-organismes comprenant des sites de liaison d'amorce pour l'amplification desdites régions ITS.