METHODS AND COMPOSITIONS FOR DNA PROFILING
Embodiments disclosed herein provide methods for constructing a DNA profile comprising: providing a nucleic acid sample, amplifying the nucleic acid sample with a plurality of primers that specifically hybridize to at least one target sequence comprising a SNP and at least one target sequence compri...
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creator | JAGER, ANNE AMINI, SASAN STEEMERS, FRANK HOLT, CYDNE WALICHIEWICZ, PAULINA SHEN, MIN-JUI RICHARD HAN, YONMEE SILVA, DAVID DAVIS, CAREY STEPHENS, KATHRYN M |
description | Embodiments disclosed herein provide methods for constructing a DNA profile comprising: providing a nucleic acid sample, amplifying the nucleic acid sample with a plurality of primers that specifically hybridize to at least one target sequence comprising a SNP and at least one target sequence comprising a tandem repeat, and determining the genotypes of the at least one SNP and at least one tandem repeat in the amplification products, thereby constructing the DNA profile of the nucleic acid sample. Embodiments disclosed herein further provide a plurality of primers that specifically hybridize to at least one short target sequence and at least one long target sequence in a nucleic acid sample, wherein amplifying the nucleic acid sample using the plurality of primers in a single reaction results in a short amplification product and a long amplification product, wherein each of the plurality of primers comprises one or more tag sequences.
L'invention concerne, selon plusieurs modes de réalisation, des procédés de génération d'un profil ADN comprenant les étapes consistant à utiliser un échantillon d'acide nucléique, à amplifier l'échantillon d'acide nucléique au moyen d'une pluralité d'amorces qui s'hybrident de façon spécifique avec au moins une séquence cible comprenant un polymorphisme mononucléotidique et au moins une séquence cible comprenant une séquence répétée en tandem, et à déterminer les génotypes dudit ou desdits polymorphismes mononucléotidiques et de ladite ou desdites séquences répétées en tandem dans les produits d'amplification, ce qui permet l'obtention du profil ADN de l'échantillon d'acide nucléique. L'invention concerne, en outre, selon d'autres modes de réalisation, une pluralité d'amorces qui s'hybrident de façon spécifique avec au moins une courte séquence cible et au moins une longue séquence cible dans un échantillon d'acide nucléique, l'amplification de l'échantillon d'acide nucléique au moyen de la pluralité d'amorces dans le cadre d'une réaction unique permettant d'obtenir un produit d'amplification court et un produit d'amplification long, chaque amorce de la pluralité d'amorces comprenant une ou plusieurs séquences étiquettes. |
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L'invention concerne, selon plusieurs modes de réalisation, des procédés de génération d'un profil ADN comprenant les étapes consistant à utiliser un échantillon d'acide nucléique, à amplifier l'échantillon d'acide nucléique au moyen d'une pluralité d'amorces qui s'hybrident de façon spécifique avec au moins une séquence cible comprenant un polymorphisme mononucléotidique et au moins une séquence cible comprenant une séquence répétée en tandem, et à déterminer les génotypes dudit ou desdits polymorphismes mononucléotidiques et de ladite ou desdites séquences répétées en tandem dans les produits d'amplification, ce qui permet l'obtention du profil ADN de l'échantillon d'acide nucléique. L'invention concerne, en outre, selon d'autres modes de réalisation, une pluralité d'amorces qui s'hybrident de façon spécifique avec au moins une courte séquence cible et au moins une longue séquence cible dans un échantillon d'acide nucléique, l'amplification de l'échantillon d'acide nucléique au moyen de la pluralité d'amorces dans le cadre d'une réaction unique permettant d'obtenir un produit d'amplification court et un produit d'amplification long, chaque amorce de la pluralité d'amorces comprenant une ou plusieurs séquences étiquettes.</description><language>eng ; fre</language><subject>BEER ; BIOCHEMISTRY ; CHEMISTRY ; COMBINATORIAL CHEMISTRY ; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR ; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL ORENZYMOLOGICAL PROCESSES ; ENZYMOLOGY ; LIBRARIES, e.g. CHEMICAL LIBRARIES, IN SILICOLIBRARIES ; MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEICACIDS OR MICROORGANISMS ; METALLURGY ; MICROBIOLOGY ; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING ; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS ; SPIRITS ; VINEGAR ; WINE</subject><creationdate>2023</creationdate><oa>free_for_read</oa><woscitedreferencessubscribed>false</woscitedreferencessubscribed></display><links><openurl>$$Topenurl_article</openurl><openurlfulltext>$$Topenurlfull_article</openurlfulltext><thumbnail>$$Tsyndetics_thumb_exl</thumbnail><linktohtml>$$Uhttps://worldwide.espacenet.com/publicationDetails/biblio?FT=D&date=20230314&DB=EPODOC&CC=CA&NR=2940048C$$EHTML$$P50$$Gepo$$Hfree_for_read</linktohtml><link.rule.ids>230,308,780,885,25564,76547</link.rule.ids><linktorsrc>$$Uhttps://worldwide.espacenet.com/publicationDetails/biblio?FT=D&date=20230314&DB=EPODOC&CC=CA&NR=2940048C$$EView_record_in_European_Patent_Office$$FView_record_in_$$GEuropean_Patent_Office$$Hfree_for_read</linktorsrc></links><search><creatorcontrib>JAGER, ANNE</creatorcontrib><creatorcontrib>AMINI, SASAN</creatorcontrib><creatorcontrib>STEEMERS, FRANK</creatorcontrib><creatorcontrib>HOLT, CYDNE</creatorcontrib><creatorcontrib>WALICHIEWICZ, PAULINA</creatorcontrib><creatorcontrib>SHEN, MIN-JUI RICHARD</creatorcontrib><creatorcontrib>HAN, YONMEE</creatorcontrib><creatorcontrib>SILVA, DAVID</creatorcontrib><creatorcontrib>DAVIS, CAREY</creatorcontrib><creatorcontrib>STEPHENS, KATHRYN M</creatorcontrib><title>METHODS AND COMPOSITIONS FOR DNA PROFILING</title><description>Embodiments disclosed herein provide methods for constructing a DNA profile comprising: providing a nucleic acid sample, amplifying the nucleic acid sample with a plurality of primers that specifically hybridize to at least one target sequence comprising a SNP and at least one target sequence comprising a tandem repeat, and determining the genotypes of the at least one SNP and at least one tandem repeat in the amplification products, thereby constructing the DNA profile of the nucleic acid sample. Embodiments disclosed herein further provide a plurality of primers that specifically hybridize to at least one short target sequence and at least one long target sequence in a nucleic acid sample, wherein amplifying the nucleic acid sample using the plurality of primers in a single reaction results in a short amplification product and a long amplification product, wherein each of the plurality of primers comprises one or more tag sequences.
L'invention concerne, selon plusieurs modes de réalisation, des procédés de génération d'un profil ADN comprenant les étapes consistant à utiliser un échantillon d'acide nucléique, à amplifier l'échantillon d'acide nucléique au moyen d'une pluralité d'amorces qui s'hybrident de façon spécifique avec au moins une séquence cible comprenant un polymorphisme mononucléotidique et au moins une séquence cible comprenant une séquence répétée en tandem, et à déterminer les génotypes dudit ou desdits polymorphismes mononucléotidiques et de ladite ou desdites séquences répétées en tandem dans les produits d'amplification, ce qui permet l'obtention du profil ADN de l'échantillon d'acide nucléique. L'invention concerne, en outre, selon d'autres modes de réalisation, une pluralité d'amorces qui s'hybrident de façon spécifique avec au moins une courte séquence cible et au moins une longue séquence cible dans un échantillon d'acide nucléique, l'amplification de l'échantillon d'acide nucléique au moyen de la pluralité d'amorces dans le cadre d'une réaction unique permettant d'obtenir un produit d'amplification court et un produit d'amplification long, chaque amorce de la pluralité d'amorces comprenant une ou plusieurs séquences étiquettes.</description><subject>BEER</subject><subject>BIOCHEMISTRY</subject><subject>CHEMISTRY</subject><subject>COMBINATORIAL CHEMISTRY</subject><subject>COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR</subject><subject>CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL ORENZYMOLOGICAL PROCESSES</subject><subject>ENZYMOLOGY</subject><subject>LIBRARIES, e.g. CHEMICAL LIBRARIES, IN SILICOLIBRARIES</subject><subject>MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEICACIDS OR MICROORGANISMS</subject><subject>METALLURGY</subject><subject>MICROBIOLOGY</subject><subject>MUTATION OR GENETIC ENGINEERING</subject><subject>PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS</subject><subject>SPIRITS</subject><subject>VINEGAR</subject><subject>WINE</subject><fulltext>true</fulltext><rsrctype>patent</rsrctype><creationdate>2023</creationdate><recordtype>patent</recordtype><sourceid>EVB</sourceid><recordid>eNrjZNDydQ3x8HcJVnD0c1Fw9vcN8A_2DPH09wtWcPMPUnDxc1QICPJ38_Tx9HPnYWBNS8wpTuWF0twM8m6uIc4euqkF-fGpxQWJyal5qSXxzo5GliYGBiYWzsaEVQAAwyYjvw</recordid><startdate>20230314</startdate><enddate>20230314</enddate><creator>JAGER, ANNE</creator><creator>AMINI, SASAN</creator><creator>STEEMERS, FRANK</creator><creator>HOLT, CYDNE</creator><creator>WALICHIEWICZ, PAULINA</creator><creator>SHEN, MIN-JUI RICHARD</creator><creator>HAN, YONMEE</creator><creator>SILVA, DAVID</creator><creator>DAVIS, CAREY</creator><creator>STEPHENS, KATHRYN M</creator><scope>EVB</scope></search><sort><creationdate>20230314</creationdate><title>METHODS AND COMPOSITIONS FOR DNA PROFILING</title><author>JAGER, ANNE ; AMINI, SASAN ; STEEMERS, FRANK ; HOLT, CYDNE ; WALICHIEWICZ, PAULINA ; SHEN, MIN-JUI RICHARD ; HAN, YONMEE ; SILVA, DAVID ; DAVIS, CAREY ; STEPHENS, KATHRYN M</author></sort><facets><frbrtype>5</frbrtype><frbrgroupid>cdi_FETCH-epo_espacenet_CA2940048C3</frbrgroupid><rsrctype>patents</rsrctype><prefilter>patents</prefilter><language>eng ; fre</language><creationdate>2023</creationdate><topic>BEER</topic><topic>BIOCHEMISTRY</topic><topic>CHEMISTRY</topic><topic>COMBINATORIAL CHEMISTRY</topic><topic>COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR</topic><topic>CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL ORENZYMOLOGICAL PROCESSES</topic><topic>ENZYMOLOGY</topic><topic>LIBRARIES, e.g. CHEMICAL LIBRARIES, IN SILICOLIBRARIES</topic><topic>MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEICACIDS OR MICROORGANISMS</topic><topic>METALLURGY</topic><topic>MICROBIOLOGY</topic><topic>MUTATION OR GENETIC ENGINEERING</topic><topic>PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS</topic><topic>SPIRITS</topic><topic>VINEGAR</topic><topic>WINE</topic><toplevel>online_resources</toplevel><creatorcontrib>JAGER, ANNE</creatorcontrib><creatorcontrib>AMINI, SASAN</creatorcontrib><creatorcontrib>STEEMERS, FRANK</creatorcontrib><creatorcontrib>HOLT, CYDNE</creatorcontrib><creatorcontrib>WALICHIEWICZ, PAULINA</creatorcontrib><creatorcontrib>SHEN, MIN-JUI RICHARD</creatorcontrib><creatorcontrib>HAN, YONMEE</creatorcontrib><creatorcontrib>SILVA, DAVID</creatorcontrib><creatorcontrib>DAVIS, CAREY</creatorcontrib><creatorcontrib>STEPHENS, KATHRYN M</creatorcontrib><collection>esp@cenet</collection></facets><delivery><delcategory>Remote Search Resource</delcategory><fulltext>fulltext_linktorsrc</fulltext></delivery><addata><au>JAGER, ANNE</au><au>AMINI, SASAN</au><au>STEEMERS, FRANK</au><au>HOLT, CYDNE</au><au>WALICHIEWICZ, PAULINA</au><au>SHEN, MIN-JUI RICHARD</au><au>HAN, YONMEE</au><au>SILVA, DAVID</au><au>DAVIS, CAREY</au><au>STEPHENS, KATHRYN M</au><format>patent</format><genre>patent</genre><ristype>GEN</ristype><title>METHODS AND COMPOSITIONS FOR DNA PROFILING</title><date>2023-03-14</date><risdate>2023</risdate><abstract>Embodiments disclosed herein provide methods for constructing a DNA profile comprising: providing a nucleic acid sample, amplifying the nucleic acid sample with a plurality of primers that specifically hybridize to at least one target sequence comprising a SNP and at least one target sequence comprising a tandem repeat, and determining the genotypes of the at least one SNP and at least one tandem repeat in the amplification products, thereby constructing the DNA profile of the nucleic acid sample. Embodiments disclosed herein further provide a plurality of primers that specifically hybridize to at least one short target sequence and at least one long target sequence in a nucleic acid sample, wherein amplifying the nucleic acid sample using the plurality of primers in a single reaction results in a short amplification product and a long amplification product, wherein each of the plurality of primers comprises one or more tag sequences.
L'invention concerne, selon plusieurs modes de réalisation, des procédés de génération d'un profil ADN comprenant les étapes consistant à utiliser un échantillon d'acide nucléique, à amplifier l'échantillon d'acide nucléique au moyen d'une pluralité d'amorces qui s'hybrident de façon spécifique avec au moins une séquence cible comprenant un polymorphisme mononucléotidique et au moins une séquence cible comprenant une séquence répétée en tandem, et à déterminer les génotypes dudit ou desdits polymorphismes mononucléotidiques et de ladite ou desdites séquences répétées en tandem dans les produits d'amplification, ce qui permet l'obtention du profil ADN de l'échantillon d'acide nucléique. L'invention concerne, en outre, selon d'autres modes de réalisation, une pluralité d'amorces qui s'hybrident de façon spécifique avec au moins une courte séquence cible et au moins une longue séquence cible dans un échantillon d'acide nucléique, l'amplification de l'échantillon d'acide nucléique au moyen de la pluralité d'amorces dans le cadre d'une réaction unique permettant d'obtenir un produit d'amplification court et un produit d'amplification long, chaque amorce de la pluralité d'amorces comprenant une ou plusieurs séquences étiquettes.</abstract><oa>free_for_read</oa></addata></record> |
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