METHODS AND COMPOSITIONS FOR DNA PROFILING

Embodiments disclosed herein provide methods for constructing a DNA profile comprising: providing a nucleic acid sample, amplifying the nucleic acid sample with a plurality of primers that specifically hybridize to at least one target sequence comprising a SNP and at least one target sequence compri...

Ausführliche Beschreibung

Gespeichert in:
Bibliographische Detailangaben
Hauptverfasser: JAGER, ANNE, AMINI, SASAN, STEEMERS, FRANK, HOLT, CYDNE, WALICHIEWICZ, PAULINA, SHEN, MIN-JUI RICHARD, HAN, YONMEE, SILVA, DAVID, DAVIS, CAREY, STEPHENS, KATHRYN M
Format: Patent
Sprache:eng ; fre
Schlagworte:
Online-Zugang:Volltext bestellen
Tags: Tag hinzufügen
Keine Tags, Fügen Sie den ersten Tag hinzu!
Beschreibung
Zusammenfassung:Embodiments disclosed herein provide methods for constructing a DNA profile comprising: providing a nucleic acid sample, amplifying the nucleic acid sample with a plurality of primers that specifically hybridize to at least one target sequence comprising a SNP and at least one target sequence comprising a tandem repeat, and determining the genotypes of the at least one SNP and at least one tandem repeat in the amplification products, thereby constructing the DNA profile of the nucleic acid sample. Embodiments disclosed herein further provide a plurality of primers that specifically hybridize to at least one short target sequence and at least one long target sequence in a nucleic acid sample, wherein amplifying the nucleic acid sample using the plurality of primers in a single reaction results in a short amplification product and a long amplification product, wherein each of the plurality of primers comprises one or more tag sequences. L'invention concerne, selon plusieurs modes de réalisation, des procédés de génération d'un profil ADN comprenant les étapes consistant à utiliser un échantillon d'acide nucléique, à amplifier l'échantillon d'acide nucléique au moyen d'une pluralité d'amorces qui s'hybrident de façon spécifique avec au moins une séquence cible comprenant un polymorphisme mononucléotidique et au moins une séquence cible comprenant une séquence répétée en tandem, et à déterminer les génotypes dudit ou desdits polymorphismes mononucléotidiques et de ladite ou desdites séquences répétées en tandem dans les produits d'amplification, ce qui permet l'obtention du profil ADN de l'échantillon d'acide nucléique. L'invention concerne, en outre, selon d'autres modes de réalisation, une pluralité d'amorces qui s'hybrident de façon spécifique avec au moins une courte séquence cible et au moins une longue séquence cible dans un échantillon d'acide nucléique, l'amplification de l'échantillon d'acide nucléique au moyen de la pluralité d'amorces dans le cadre d'une réaction unique permettant d'obtenir un produit d'amplification court et un produit d'amplification long, chaque amorce de la pluralité d'amorces comprenant une ou plusieurs séquences étiquettes.