NANO46 GENES AND METHODS TO PREDICT BREAST CANCER OUTCOME

The present invention provides methods for classifying and for evaluating the prognosis of a subject having breast cancer are provided. The methods include prediction of breast cancer subtype using a supervised algorithm trained to stratify subjects on the basis of breast cancer intrinsic subtype. The prediction model is based on the gene expression profile of the intrinsic genes listed in Table 1. Further provided are compositions and methods for predicting outcome or response to therapy of a subject diagnosed with or suspected of having breast cancer. These methods are useful for guiding or determining treatment options for a subject afflicted with breast cancer. Methods of the invention further include means for evaluating gene expression profiles, including microarrays and quantitative polymerase chain reaction assays, as well as kits comprising reagents for practicing the methods of the invention. La présente invention concerne des procédés pour classifier et évaluer le pronostic d'un sujet présentant un cancer du sein. Les procédés comprennent la prédiction d'un sous-type du cancer du sein à l'aide d'un algorithme supervisé entraîné pour stratifier des sujets sur la base du sous-type intrinsèque du cancer du sein. Le modèle de prédiction repose sur le profil d'expression génique des gènes intrinsèques listés dans le Tableau 1. L'invention concerne en outre des compositions et des procédés pour la prédiction de l'évolution ou de la sensibilité à une thérapie d'un sujet diagnostiqué comme atteint du cancer du sein ou étant présumé avoir un cancer du sein. Ces procédés sont utiles pour le guidage ou la détermination des options de traitement pour un sujet atteint d'un cancer du sein. Les procédés de l'invention comprennent en outre des moyens d'évaluation des profils d'expression génique, comprenant des microréseaux et des dosages de réaction en chaîne de la polymérase quantitative, ainsi que des trousses comprenant des réactifs pour la mise en uvre des procédés de l'invention.