OLIGONUCLEOTIDES AND METHODS FOR DETECTING PIK3CA MUTATIONS

Provided are oligonucleotides that are capable of detecting KRAS and PIK3CA mutations in both cancer patients and healthy individuals with high specificity in kPCR assays. When the oligonucleotides are used as forward primers in conjunction with a defined genotyping algorithm spreadsheet, the primer...

Ausführliche Beschreibung

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Bibliographische Detailangaben
Hauptverfasser:	UZGIRIS, AREJAS, YING, ANDY, DETMER, JILL
Format:	Patent
Sprache:	eng ; fre
Schlagworte:	BEER BIOCHEMISTRY CHEMISTRY COMPOSITIONS THEREOF CULTURE MEDIA DERIVATIVES THEREOF ENZYMOLOGY FERMENTATION OR ENZYME-USING PROCESSES TO SYNTHESISE A DESIREDCHEMICAL COMPOUND OR COMPOSITION OR TO SEPARATE OPTICAL ISOMERSFROM A RACEMIC MIXTURE METALLURGY MICROBIOLOGY MICROORGANISMS OR ENZYMES MUTATION OR GENETIC ENGINEERING NUCLEIC ACIDS NUCLEOSIDES NUCLEOTIDES ORGANIC CHEMISTRY PROPAGATING, PRESERVING OR MAINTAINING MICROORGANISMS SPIRITS SUGARS VINEGAR WINE
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Beschreibung
Zusammenfassung:	Provided are oligonucleotides that are capable of detecting KRAS and PIK3CA mutations in both cancer patients and healthy individuals with high specificity in kPCR assays. When the oligonucleotides are used as forward primers in conjunction with a defined genotyping algorithm spreadsheet, the primers are capable of enhancing detection of KRAS codon 12, 13, and 61 and PIK3CA codon 542, 545, and 1047 single nucleotide polymorphisms (SNPs) in a background of wild-type sequences. The oligonucleotides of the present invention are also capable of preventing pseudogene amplification when the oligonucleotides are hybridized as reverse primers or detection probes to the mismatch sequences. La présente invention concerne des oligonucléotides qui sont capables de détecter des mutations de KRAS et de PIK3CA à la fois chez les patients atteints de cancer et chez les individus sains avec une grande spécificité dans des dosages par kPCR. Lorsque les oligonucléotides sont utilisés en tant qu'amorces sens en conjonction avec une feuille de données d'algorithme de génotypage défini, les amorces sont capables d'améliorer la détection des polymorphismes mononucléotidiques (SNP) des codons 12, 13 et 61 de KRAS et 542, 545 et 1047 de PIK3CA dans un contexte de séquences sauvages. Les oligonucléotides de la présente invention sont également capables de prévenir l'amplification de pseudogènes lorsque les oligonucléotides sont hybridés comme des amorces antisens ou des sondes de détection aux séquences mésappariées.