RAPID AND QUANTITATIVE PROTEOME ANALYSIS AND RELATED METHODS

The invention provides methods for identifying polypeptides by simultaneously determining the mass of a subset of parent polypeptides from a population of polypeptides and the mass of fragments of the subset of parent polypeptides; comparing the determined masses to an annotated polypeptide index; and identifying one or more polypeptides of the annotated polypeptide index having the determined masses. The invention also provides methods for identifying a polypeptide by determining two or more characteristics associated with the polypeptide, or a fragment thereof, one of the characteristics being mass of a fragment of the polypeptide, the fragment mass being determined by mass spectrometry; comparing the characteristics associated with the polypeptide to an annotated polypeptide index; and identifying one or more polypeptides in the annotated polypeptide index having the characteristics. The method can additionally include the step of quantitating the amount of the identified polypeptide in a sample containing the polypeptide. La présente invention concerne des procédés permettant d'identifier des polypeptides par déterminer simultanée de la masse d'un sous-ensemble de polypeptides parents à partir d'une population de polypeptides et de la masse des fragments du sous-ensemble de polypeptides parents; par comparaison des masses déterminées avec un index de polypeptides explicatif; puis par identification d'un ou de plusieurs polypeptides de l'index de polypeptides explicatif présentant les masses déterminées. La présente invention concerne également des procédés permettant d'identifier un polypeptide, par détermination de deux caractéristiques, ou plus, associées au polypeptide, ou à un fragment de celui-ci, l'une de ces caractéristiques étant la masse d'un fragment du polypeptide, laquelle masse étant déterminée par spectrométrie de masse; par comparaison des caractéristiques associées au polypeptide avec un index de polypeptides explicatif; puis par identification d'un ou de plusieurs polypeptides dans cet index de polypeptides explicatif présentant lesdites caractéristiques. Le procédé décrit dans cette invention peut également comprendre l'étape consistant à quantifier la quantité de polypeptide identifié dans un échantillon contenant le polypeptide.