PAINEL GENÉTICO NO PROGNÓSTICO E PREDIÇÃO DE NEOPLASIA ORAL

PAINEL GENÉTICO NO PROGNÓSTICO E PREDIÇÃO DE NEOPLASIA ORAL. A presente invenção descreve um painel para prognóstico de Câncer Oral que prevê o diagnóstico, prognóstico e predição de neoplasias oral através da detecção do um aumento ou diminuição da expressão gênica de um ou mais dos biomarcadores, relacionados a recorrência, progressão ou metástase da doença. O painel utiliza o perfil de expressão obtidos pelas análises de RNAseq, enfatizando a sobrevida, o estadiamento, o subtipo e a recidiva nos diferentes subtipos. Para as análises foram selecionados dados de RNAseq do TCGA, estratificados por local da lesão e por estadiamento. Posteriormente, usando o software TCGAbiolinks no software R, foram feitas análises de expressão diferencial. Os genes obtidos foram submetidos à análise no KMPLOT, sendo selecionados aqueles que impactavam negativamente a sobrevida. Para visualizar das vias de associação dos genes selecionados, executou-se o Functional Annotation Bioinformatics Microarray Analysis (DAVID). Outros métodos foram usados para confirmar os dados, identificar as vias metabólicas e a associação do gene com a recidiva tumoral.