MÉTODO E USO PARA VERIFICAÇÃO DE ERROS DE MONTAGEM EM GENOMAS

MÉTODO E USO PARA VERIFICAÇÃO DE ERROS DE MONTAGEM EM GENOMAS A presente invenção trata-se de um método para verificação de erros de montagem em genomas de organismos sequenciados ou produzidos de maneira sintética que utiliza relações de frequência entre fragmentos de sequências de nucleotídeos de...

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Hauptverfasser: MICHEL EDUARDO BELEZA YAMAGISHI, ROBERTO HIROCHI HERAI
Format: Patent
Sprache:por
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Zusammenfassung:MÉTODO E USO PARA VERIFICAÇÃO DE ERROS DE MONTAGEM EM GENOMAS A presente invenção trata-se de um método para verificação de erros de montagem em genomas de organismos sequenciados ou produzidos de maneira sintética que utiliza relações de frequência entre fragmentos de sequências de nucleotídeos de um genoma. O método possui aplicações na verificação de erros em um genoma montado a partir de fragmentos oriundos dos diferentes tipos de tecnologias de sequenciamento e auxiliar na construção de genomas sintéticos, como por exemplo. Pode ser empregado para compressão de material genético, pois as relações de frequência determinadas pelo método permitem reduzir a complexidade de sequências de nucleotídeos, de forma a representar seu conteúdo de maneira comprimida, reduzindo assim o espaço necessário para seu armazenamento. The present invention relates to a method for verification of mounting errors in genomes of organisms, which genomes have been sequenced or produced synthetically, which utilizes frequency relationships between nucleotide sequence fragments of a genome. The method is of use in the verification of errors in a mounted genome based on fragments produced using different types of sequencing technology and assists in the construction of synthetic genomes, for example. The present invention may be used to compress genetic material since the frequency relationships determined by the method allow reduction of the nucleotide sequence complexity in such a manner as to represent the content thereof in compressed form, thereby reducing the space required for storage thereof.