Molecular detection of shiga toxin (stx1 and stx2) and intimin (eaea) genes in escherichia coli isolated from fecal samples of cattle, sheep, and human in basrah governorate

تهدف الدراسة الحالية الى عزل و تحديد الايشريكا القولونية المعزولة من براز الحيونات الحقلية ( الابقار و الاغنام ) و الانسان. و ايضا تهدف الى الكشف الجزيئي لجينات الشيغا و الانتمين في العزلات. اذ تم جمع (264) عينة براز و مسحات من اماكن مختلفة من مدينة البصرة للفترة من ايلول 2018 لغاية كانون الثاني 2019. العينات التي تم جمعها تكونت من (85) عينة من الابقار، (94) عينة من الانسان و ( 85) عينة من الاغنام. تم استخدام تقنيات مختلفة للكشف عن وجود الايشريكا القولونية و هذه التقنيات شملت الاختبارات البكتيريولوجية التقليدية و التقنيات الجزيئية و التي تتضمن ( تضخيم جين uidA باستخدام تقنية تفاعل البلمرة المتسلسل). نتائج هذه التقنيات تشير الى تحديد 50 ( 18. 9%) عينة تم اعتبارها E. coli. خضعت هذه العزلات الى تفاعل البلمرة المتسلسل للكشف عن جينات ذيفان الشيغا) و الانتيمين (eaeA، and stx1، stx2). نتائج البلمرة اكدت ان كل العزلات (50) تمتلك على الاقل جين ضراوة و احد. من بين 50 عزلة وجد 20( 40%) من العزلات تحمل جين stx2 فقط، و كانت نسبة العزل ( 66. 7%، 41. 7% و % 23. 5) من عينات الانسان، الاغنام و الابقار، على التوالي. كما تم كشف جينات stx1and stx2) معا بنسبة9/50 (18%)، تمثل (%52. 9) من عزلات الابقار. تم كشف جين eaeA) ) لوحده بنسبة 2/50 (4%)، و يمثل 11. 8 %) من عزلات الابقار. (28%) من العزلات تمتلك جينات (eaeA، and stx2، )، هذه العزلات تنتمي الى عزلات الانسان و الاغنام (33. 3 %) و ( 45. 8%) على التوالي. تم كشف وجود الجينات (eaeA، and stx1، stx2) في 10% من العزلات، ( 11. 8%) من الابقار و ( 12. 5%) من الاغنام. العزلات التي تم تاكيدها بتفاعل البلمرة تم اختبارها باستخدام الحساسية الدوائية ضد 7 من المضادات الحيوية و بينت النتائج ان اعلى مقاومة كانت ضد الامبيسيلن و التتراساكلين(92%، 74%) على التوالي، في حين كانت العزلات حساسة الى الايميبينيمن، الجنتامايسين، الكلورامفينيكول، سيبروفلوكساسين و سيفوتاكسيم بنسبة (100%، 92%، 78%، 68 و 58%) على التوالي. The present study aims to isolate and identify Escherichia coli from fecal samples of farm animals and human, also, it aims to molecular detection of shigatoxin and intimin genes in isolates. A total of (264) fecal samples and swwere collected from different parts of Basrah in the period extending from September 2018 to January 2019. These samples were composed of (85) samples from cows, (94) samples from humanand (85) samples from sheep. Different techniques were used in this study to detect the presence of E. coli; these techniques included conventional microbiological assays and molecular techniques (amplification of uidA gene by using polymerase chain reaction). The results of these techniques indicated 50 (18. 9%) were E. coli from the