Brown trout in Japan − introduction history, distribution and genetic structure

Brown trout Salmo trutta L. lives mainly in European rivers and is also bred in hatcheries for fishery purposes. Since the end of 19th century it has been introduced in all other continents. For the present survey most of the known self-sustaining brown trout river populations in Japan have been sampled and analyzed through sequences of the entire mitochondrial DNA control region and twelve microsatellites. In Japan, brown trout are genetically not homogeneous, probably as a consequence of several introductions, one in the Azusa river and at least one other in the remaining territory. The Chuzenji hatchery houses a genetically very distinct strain, probably due to intense manipulation in isolated scientific experimentations over 30 years. Finally, most populations showed high genetic diversity (Mamachi, Kane and Odori streams, Lake Chuzenji) with the exception of the Azusa river samples. This molecular analysis clearly demonstrates a European north Atlantic origin arrived in two distinct ways. La truite commune, Salmo trutta L., est essentiellement une espèce vivant dans les rivières européenne. Elle est aussi élevée dans des piscicultures pour le repeuplement. Elle a été introduite dans tous les continents depuis la fin du XIX e siècle. Au Japon, la plupart des populations pérennes de truites ont été échantillonnées pour la présente étude et analysées au niveau de toute la région de contrôle de l'ADN mitochondrial et de douze microsatellites. Dans ce pays, les truites introduites ne sont pas génétiquement homogènes, probablement la conséquence de plusieurs introductions, une dans la rivière Azusa et au moins une dans le territoire restant. La pisciculture Chuzenji abrite une souche génétiquement très différente, ce qui est probablement dû à des manipulations intenses lors d'expériences scientifiques effectuées en isolement depuis une trentaine d'années. Finalement, la plupart des populations ont montré une grande diversité génétique (rivières Mamachi, Kane et Odori, lac Chuzenji) à l'exception des échantillons de la rivière Azusa. Cette étude moléculaire a clairement montré l'origine européenne nord-atlantique de ces populations introduites par deux voies distinctes.