Enriching the bovine microsatellite Radiation Hybrid map with AFLP markers [Amplified Fragment Length Polymorphism; DNA]

[The AFLP technology was adapted to Radiation Hybrid (RH) panels by increasing the number of selective nucleotides at 3´ of utilized primers, simplifying the electrophoretic pattern and reducing the probability of co-migration of bovine specific bands with the ones of hamster. Thirty seven primer co...

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Veröffentlicht in:Italian journal of animal science 2003-01, Vol.2 (1S), p.28-30
Hauptverfasser: Gorni, C. (Università Cattolica del Sacro Cuore, Piacenza (Italy). Istituto di Zootecnica), Ajmone-Marsan, P. (Università Cattolica del Sacro Cuore, Piacenza (Italy). Istituto di Zootecnica), Negrini, R. (Università Cattolica del Sacro Cuore, Piacenza (Italy). Istituto di Zootecnica), Eijk, M.J.T. Van (Keygene N.V., Wageningen (Netherlands)), Zevenbergen, M. (Keygene N.V., Wageningen (Netherlands)), Heuven, H. (Keygene N.V., Wageningen (Netherlands)), Peleman, J. (Keygene N.V., Wageningen (Netherlands)), Waddington, D. (Roslin Institute, Midlothian (UK)), Williams, J.L. (Roslin Institute, Midlothian (UK))
Format: Artikel
Sprache:eng
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Beschreibung
Zusammenfassung:[The AFLP technology was adapted to Radiation Hybrid (RH) panels by increasing the number of selective nucleotides at 3´ of utilized primers, simplifying the electrophoretic pattern and reducing the probability of co-migration of bovine specific bands with the ones of hamster. Thirty seven primer combinations produced 747 bands of bovine origin. Of these, 650 resulted significantly associated by two point test to 1,222 microsatellite markers already mapped on the 29 autosomes and on X and Y bovine chromosomes. The preliminary multipoint map of BTA20, confirming the usefulness of AFLP markers to enrich the RH maps and to support position cloning studies, is reported.] La tecnologia AFLP è stata adattata all´analisi di pannelli di ibridi di radiazione incrementando il numero di nucleotidi selettivi al 3´ dei primer utilizzati, così semplificando il profilo elettroforetico e riducendo la probabilità di comigrazione delle bande bovine con quelle di criceto. Trentasette combinazioni di primer hanno prodotto 747 bande di origine bovina. Di queste, 650 sono risultate significativamente associate con test a due punti a 1.222 marcatori microsatelliti già mappati sui 29 autosomi e sui cromosomi X e Y del bovino. Si riporta la mappatura preliminare multipoint di BTA20, che conferma l´utilità dei marcatori AFLP per arricchire le mappe RH e favorire studi di clonaggio per posizione
ISSN:1594-4077
1828-051X
DOI:10.4081/ijas.2003.s1.28