Exploration of the Perturbation of PKIG in Lung Squamous Cell Carcinoma and the Role in Tumor Microenvironment Based on Bioinformatics Method

背景与目的 肺癌是全球癌症相关死亡的主要原因,患者从手术、放疗和化疗这些传统治疗方法中生存获益有限。免疫疗法作为肺癌的一种新兴治疗手段,显著延长了患者的总生存期(overall survival, OS),然而,仅有一部分患者能够从中获益,需要我们更深入地探索免疫治疗生物标志物以筛选优势人群。方法 从癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas, TCGA)和基因表达综合数据库(Gene Expression Omnibus, GEO)下载原始数据,利用R软件和TIMER数据库筛选肺鳞癌(lung squamous cell carcinoma, LUSC)免疫预后相关基因。...

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Veröffentlicht in:Zhongguo fei ai za zhi 2023-07, Vol.26 (7), p.523-537
Hauptverfasser: LIU, Qing, LI, Haitian, LI, Bin, REN, Meiyu, LI, Zhenqing, CHEN, Yuzhen, ZHENG, Zhizhong, MENG, Yuqi, FENG, Haiming
Format: Artikel
Sprache:chi
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Beschreibung
Zusammenfassung:背景与目的 肺癌是全球癌症相关死亡的主要原因,患者从手术、放疗和化疗这些传统治疗方法中生存获益有限。免疫疗法作为肺癌的一种新兴治疗手段,显著延长了患者的总生存期(overall survival, OS),然而,仅有一部分患者能够从中获益,需要我们更深入地探索免疫治疗生物标志物以筛选优势人群。方法 从癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas, TCGA)和基因表达综合数据库(Gene Expression Omnibus, GEO)下载原始数据,利用R软件和TIMER数据库筛选肺鳞癌(lung squamous cell carcinoma, LUSC)免疫预后相关基因。在TCGA和GEO数据库中研究了目标基因的表达情况,并通过R软件和TISIDB数据库对目标基因进行基因本体(Gene Ontology, GO)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes, KEGG)富集分析以及与肿瘤免疫特征之间的相关性分析。结果 我们筛选出cAMP依赖性蛋白激酶抑制剂γ(protein kinase inhibitor gamma, PKIG)这个免疫预后相关基因,PKIG在LUSC和正常组织中的表达有明显差异,并对LUSC的诊断和预后评估具有重要参考价值。PKIG差异基因主要集中富集在体液免疫反应的调节等过程。PKIG的表达与调节性T细胞(regulatory T cells, Tregs)的浸润水平呈正相关(r=0.340, P
ISSN:1009-3419
1999-6187
DOI:10.3779/j.issn.1009-3419.2023.102.24