Construction of Lung Adenocarcinoma Prognosis Model and Drug Sensitivity Analysis Based on Cuproptosis Related Genes
背景与目的 肺癌是全球最常见的恶性肿瘤之一,目前肺癌筛查和治疗策略不断完善,但其5年生存率仍然很低,严重危害人类的健康。因此探索新的生物标志物,提供个体化治疗并改善患者预后至关重要。铜死亡是一种新发现的细胞死亡类型,是由于细胞内过量铜离子积累,最终导致细胞死亡,已有研究提示其与肺腺癌(lung adenocarcinoma, LUAD)的发生发展密切相关。本研究基于肿瘤基因组图谱(The Cancer Genome Atlas, TCGA)数据库,探究铜死亡相关基因(cuproptosis related gene, CRGs)与LUAD预后之间的关联,建立预后风险模型并分析CRGs与LUAD...
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Veröffentlicht in: | Zhongguo fei ai za zhi 2023-08, Vol.26 (8), p.591-604 |
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Format: | Artikel |
Sprache: | chi |
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Online-Zugang: | Volltext |
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Zusammenfassung: | 背景与目的 肺癌是全球最常见的恶性肿瘤之一,目前肺癌筛查和治疗策略不断完善,但其5年生存率仍然很低,严重危害人类的健康。因此探索新的生物标志物,提供个体化治疗并改善患者预后至关重要。铜死亡是一种新发现的细胞死亡类型,是由于细胞内过量铜离子积累,最终导致细胞死亡,已有研究提示其与肺腺癌(lung adenocarcinoma, LUAD)的发生发展密切相关。本研究基于肿瘤基因组图谱(The Cancer Genome Atlas, TCGA)数据库,探究铜死亡相关基因(cuproptosis related gene, CRGs)与LUAD预后之间的关联,建立预后风险模型并分析CRGs与LUAD免疫细胞浸润之间的相互作用,为肺腺癌患者的治疗及预后提供参考。方法 从TCGA数据库中下载LUAD组织和癌旁或正常肺组织的RNA-seq数据,从基因型-组织表达资料库(Genotype-tissue Expression, GTEx)下载正常肺组织的RNA-seq数据,并从基因表达综合数据库(Gene Expression Omnibus, GEO)下载462例肺腺癌数据作为验证,采用单因素Cox和Lasso-Cox回归分析构建评估预后的风险评分模型,用受试者工作特征(receiver operating characteristic, ROC)曲线及校准曲线评价模型的预测能力。并进一步对高、低风险组进行免疫相关和药物敏感性分析。结果 共得到1656个CRGs,其中有1356个存在差异表达的CRGs,基于单因素Cox和Lasso-Cox回归分析筛选出13个CRGs构建预后风险模型,ROC曲线1、3、5年的曲线下面积(area under the curve, AUC)分别为0.749、0.740、0.689。进一步研究高、低风险组之间免疫相关功能和免疫检查点差异分析。高风险组对萨沃替尼、帕博西尼、阿糖胞苷等药物敏感性更高,更容易从免疫治疗中获益。结论 基于13个CRGs构建的风险模型具有较好的预后价值,可以辅助LUAD患者进行个体化治疗,为LUAD的治疗及预后研究提供了重要理论依据。Background and objective Lung cancer is one of the most common malignant tumors in the world, and the current lung cancer s |
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ISSN: | 1009-3419 1999-6187 |
DOI: | 10.3779/j.issn.1009-3419.2023.102.31 |