Genetic diversity and virulence pattern in field populations of Pyricularia grisea from rice cultivar Metica-1

Rice blast is a major yield constraint of the irrigated rice in the State of Tocantins, Brazil. The objective of this investigation was to study the phenotypic and genetic diversity within the pathogen population of Pyricularia grisea in samples collected from four individual farms of rice cultivar...

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Veröffentlicht in:Pesquisa agropecuaria brasileira 2002-12, Vol.37 (12), p.1681-1688
Hauptverfasser: Filipi, M.C, Prabhu, A.S, Araújo, L.G. de, Faria, J.C. de
Format: Artikel
Sprache:eng
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Beschreibung
Zusammenfassung:Rice blast is a major yield constraint of the irrigated rice in the State of Tocantins, Brazil. The objective of this investigation was to study the phenotypic and genetic diversity within the pathogen population of Pyricularia grisea in samples collected from four individual farms of rice cultivar Metica-1, under epidemic conditions of leaf blast. A set of 87 isolates was tested on 32 rice genotypes including eight international differentials. Considering 80% similarity in virulence, two groups comprising a total of 81 isolates were recognized, independently of the farms from which they were collected. Eighty percent of the isolates pertained to pathotype ID-14, indicating high cultivar specificity and narrow diversity of virulence in the sample population. The virulence in pathogen population on rice cultivars BR-IRGA 409 and Rio Formoso was low. Analysis of P. grisea isolates using rep-PCR with two primer sequences from Pot2 generated fingerprint profiles of one to nine bands. Cluster analysis revealed the occurrence of six fingerprint groups with similarities ranging from 0.09 to 1. There was no straight relationship between virulence of the isolates based on reaction pattern on 32 genotypes and grouping based on Pot2 rep-PCR analysis of P. grisea isolates collected from 'Metica-1'. A brusone é um dos fatores limitantes para a produção de arroz de várzea no Estado do Tocantins. A diversidade fenotípica e genética em população de Pyricularia grisea foi estudada, em amostras coletadas em quatro lavouras da cultivar Metica-1, sob condições de epidemias de brusone nas folhas. Foram testados 87 isolados em 32 genótipos, incluindo oito diferenciadoras internacionais. Considerando 80% de similaridade em virulência, dois grupos compostos por 81 isolados foram identificados, independentemente das lavouras onde foram coletados. Oitenta por cento dos isolados pertencem ao patótipo ID-14, indicando alta especificidade da cultivar e a diversidade estreita em virulência na população estudada. A virulência da população do patógeno nas cultivares comerciais BR-IRGA 409 e Rio Formoso foi baixa. A análise de isolados de P. grisea utilizando rep-PCR com dois primers Pot2 gerou de uma a nove bandas. A análise de agrupamento revelou a ocorrência de seis grupos ou linhagens com similaridade variando de 0,09 a 1. Não houve uma relação clara entre a virulência dos isolados dos 32 genótipos e o agrupamento baseado na análise usando rep-PCR de Pot2 de isolados de P. grisea cole
ISSN:0100-204X
1678-3921
1678-3921
0100-204X
DOI:10.1590/S0100-204X2002001200002